工程碩士專業學位的學習分二個階段：
1、課程學習階段：學習完規定的課程可獲得工程碩士學位研修班結業證書。
2、學位考試階段：
（1）考試科目：數學、外語、專業基礎課、專業綜合課，其中數學、外語為全國聯考，專業基礎課、專業綜合課考試由學校組織命題。
（2）其中聯考科目的主要內容：外語（英、日、俄、德）和數學筆試3小時。英語考試要求接近英語四級水平，考試的主要內容：基礎語法；辭彙（構詞法、同義詞、近義詞重點複習、常用詞組及搭配）；完形填空；閱讀理解；翻譯（短文/段落畫線部分翻譯，短文/段落全文翻譯，材料包括：國際時事政治、工程與科技、計算機網路、人文社會與環境知識、健康與風土人情）。
數學考試的主要內容：高等數學部分：函式\極限與連續、一元函式微分學、一元函式積分學、多元函式微分學、多元函式積分學、無窮級數、常微分方程。線性代數部分：行列式、矩陣、向量、線性方程組。
（3）考試方式、考試時間及考務安排：碩士學位考試分全國聯考和培養單位自行組織考試兩段進行。
（a）全國聯考的科目- 數學和外語考試將於每年10月中旬舉行，其命題、考務及閱卷工作由國務院學位辦及各省市學位辦組織實施。
（b）培養單位自行組織考試的科目、時間及考務安排由各高校招生院系組織實施。
3、錄取：根據當年國家相關檔案政策及考生考試成績，擇優錄取。
4、學位論文：
（1）論文選題應直接來源於生產實際或者具有明確的生產背景和套用價值，可以是一個完整的工程項目策劃、工程設計項目或技術改造項目，可以是技術攻關研究專題，可以是新工藝、新設備、新材料、新產品的研製與開發。論文選題應有一定的技術難度、先進性和工作量，能體現作者綜合運用科學理論、方法和技術手段解決工程實際問題的能力。
（2）論文形式：（1）工程設計；（2）研究論文。
攻讀工程碩士專業學位研究生必須完成培養方案中規定的所有環節，成績合格，方可申請參加學位論文答辯。
5、學位授予：通過課程考試取得規定學分並通過學位論文答辯的研究生，由培養單位學位評定委員會審核批准授予工程碩士專業學位。