一、1999年7月，財政部、國家稅務總局發布了《關於中關村科技園區軟體開發生產企業有關稅收政策的通知》及《關於中關村科技園區軟體開發生產企業有關稅收政策的通知》。北京市國家稅務局在以京國稅[1999]147號檔案轉發這兩份檔案時明確規定：符合規定條件的軟體開發生產企業增值稅一般納稅人（以下簡稱軟體納稅人），對其自行開發或自行開發生產的軟體產品，可選擇按6％的徵收率計算繳納增值稅（以下簡稱簡易計稅辦法）。軟體納稅人選擇簡易計稅辦法後，在一個公曆年度內不得變更，選擇簡易計稅辦法計算繳納增值稅的軟體產品，其相應的進項稅額不得抵扣。需開具增值稅專用發票時，應按6％的徵收率開具增值稅專用發票。
對軟體納稅人自行開發或自行開發生產的軟體產品，經主管稅務機關審核確認，從次月起，按6％的徵收率徵收增值稅。
對選擇按簡易計稅辦法繳納增值稅的軟體納稅人兼營其他貨物或應稅勞務，或將軟體產品隨同計算機網路、計算機硬體、機器設備一併銷售的，應按規定分別核算不同稅率、徵收率產品的銷售額，分別按適用稅率或徵收率計算繳納增值稅並開具增值稅專用發票。
軟體產品所發生的進項稅額不得抵扣，如不能準確劃分，應按以下順序確定當期不得抵扣的進項稅額：
1.按當期實際生產成本計算應扣減的進項稅額；
2.按銷售額比例法計算應扣減的進項稅額。
二、1999年6月，為貫徹落實《國務院關於建設中關村科技園區有關問題的批覆》（國函[1999]45號）的精神，北京市國家稅務局、地方稅務局根據《財政部、國家稅務總局關於中關村科技園區軟體開發生產企業有關稅收政策的通知》（財稅字[1999]192號）的規定，就中關村高科技園區內的軟體開發生產企業享受有關稅收優惠政策制定了具體執行辦法。
辦法規定，對北京市中關村高科技園區內的一般納稅人銷售其自行開發生產的計算機軟體產品，由當地主管稅務機關會同科技主管部門認定批准後，可按簡易辦法依照6％的徵收率計算繳納增值稅，並可按6％的徵收率開具增值稅專用發票。計算機軟體產品是指記載有電腦程式及其有關文檔的存儲介質（包括軟碟、硬碟和光碟等）；
對經國家著作權局註冊登記，在銷售時一併轉讓著作權、所有權的計算機軟體徵收營業稅；對未經國家著作權局註冊登記或未轉讓著作權、所有權的計算機軟體銷售業務一律徵收增值稅；對隨同計算機網路、計算機硬體、機器設備等一併銷售的軟體產品，應當分別核算銷售額。如果未分別核算或核算不清，應按照計算機網路、計算機硬體、機器設備的適用稅率徵收增值稅。
三、為貫徹落實《財政部、國家稅務總局關於貫徹落實中共中央國務院關於加強技術創新發展高科技實現產業化的決定有關稅收問題的通知》精神，1999年11月，北京市國家稅務局作出規定（京國稅[1999]183號）：
（一）企業自行開發、自行開發並生產或專門生產，且符合下列條件之一的軟體產品，可以申請享受增值稅即征即退優惠政策（以下簡稱即征即退政策）：
1.在國家著作權局註冊登記，持有國家著作權局頒發的《計算機軟體著作權登記證書》的軟體產品；
2.持有北京市軟體企業和軟體產品認證小組頒發的《軟體產品證書》的軟體產品；
3.根據國家有關部委下達的研製開發項目、任務書或計畫，研製開發、生產，並具備部級（含部級）以上有關部門鑑定證書的軟體產品；
4.購買軟體產品著作權、使用許可權（指持有國家著作權局頒發的《計算機軟體權利轉移備案證書》或購銷雙方簽定的軟體使用許可權轉讓契約、協定的軟體產品）並自行生產的軟體產品。