2003年11月底，湖北省保康縣國稅局在稅務檢查中發現，某農機公司在納稅申報中，將農機、農機零配件混在一起計入銷售收入，按“農用機械”申報減免稅。稽查人員通過詳查購進發票、盤點倉庫實物，將農機、農機零配件銷售區分開，將農機零配件銷售額315560元從免稅銷售額中剔出，按17％的稅率據實查補稅款53645.20元，並對該公司給予了處罰。
該公司為何將農機、農機零配件混在一起計入銷售收入？農機屬於免稅產品，農機零配件屬於免稅範圍之外的應稅產品。兩者混在一起計入銷售後，按免稅項目“農機”申報時，如果主管稅務機關不詳細核查，很可能使免稅產品和應稅產品“同船過渡”。
農機銷售免徵增值稅。財政部、國家稅務總局財稅字［1994］004號檔案規定，“批發和零售的種子、種苗、化肥、農藥、農機”在1995年底以前免徵增值稅。其後，財政部、國家稅務總局相繼出台了多個檔案延長其免稅期限。如2001年7月23日，財政部、國家稅務總局《關於若干農業生產資料征免增值稅政策的通知》（財稅字［2001］113號）第一條第4款規定，對“批發和零售的種子、種苗、化肥、農藥、農機”免徵增值稅。
農機、農機零配件是兩個不同的概念。農機享受增值稅優惠，不等於農機零配件也享受增值稅優惠，農機零配件不屬於免稅項目的政策範圍。換言之，農機零配件銷售屬於應徵稅項目，應按17％的稅率繳納增值稅。《增值稅暫行條例》第十七條規定：“納稅人兼營免稅、減稅項目的，應當單獨核算免稅、減稅項目的銷售額；未單獨核算銷售額的，不得免稅、減稅。”
因此，在此給涉及此類業務的納稅人提個醒：納稅申報時，應分別核算農機、農機零配件銷售額。如果納稅人不分別核算農機、農機零配件銷售額，不僅稅收免徵優惠“泡湯”，還可能要承擔稅收法律責任的風險。