煤炭資源稅的減稅、免稅，應嚴格按照財政部《關於對煤炭實行從量定額徵收資源稅的通知》的規定辦理，並有如下補充規定：
1.國家統配煤礦及省屬國營煤礦之新投產礦井，從投產之日起，給予適當的減、免稅照顧：（1）年生產能力在30萬噸以下的（含30萬噸），第一年免徵，第二年減半徵收；（2）年生產能力在30萬噸至120萬噸的（含120萬噸），第一、二年免徵，第三年減半徵收；（3）年生產能力在120萬噸以上的，第一、二、三年免徵，第四年減半徵收；（4）減免稅期滿後個別仍有困難的，按稅收管理許可權經審查批准後減稅。
2.對開採經國家煤炭主管部門批准報廢礦井的邊角殘煤者，減半徵收資源稅。
3.煤炭資源稅的減免稅許可權，除另有規定外，納稅人因特殊情況需要減稅、免稅的，經當地稅務機關審查核實後，一律報國家稅務局審批。
4.考慮到目前煤炭價格還沒有完全理順，部分統配礦按規定的稅額納稅有一定的困難，決定對這些企業實行臨時減稅（具體減稅額度見附表），待煤炭調價後恢復徵稅。