財政部、國家稅務總局此次下發的《關於個人股票期權所得徵收個人所得稅問題的通知》（財稅[2005]35號），從企業員工股票期權（以下簡稱股票期權）所得性質的確定、應納稅款的計算、徵收管理等方面對股票期權所得適用的個人所得稅政策進行了明確。從2005年7月1日起，實施股票期權計畫企業授予企業員工的股票期權所得，應按該檔案和《個人所得稅法》的有關規定徵收個人所得稅。
一直以來，對於企業員工參與企業股票期權計畫取得的所得應在哪個環節以及如何繳納個人所得稅的問題，我國稅法並未明確作出規定。近年來，國內多家國有控股公司、高科技公司等上市企業進行了企業員工股票期權的試點，財稅與證券領域要求有關部門儘快明確針對個人股票期權所得的個人所得稅政策的呼聲日高。
該項政策出台，體現兩方面的意圖，其一，政策針對的是"企業內部職工股"，而非股民在流通市場上買賣股票的所得。對於普通股民在流通市場的所得，基於保護資本市場及其投資者利益的考慮，目前並不徵收個人所得稅。其二，企業員工由股票期權獲得收益，與流通市場獲利不同，基本沒有風險可言，對這一部分所得徵稅，也體現稅務總局在進一步加大稅收征管力度，逐步加強個稅征管。
一、股票期權及股票期權所得
1、股票期權，是指上市公司按照規定的程式授予本公司及其控股企業員工的一項權利，該權利允許被授權員工在未來時間內以某一特定價格購買本公司一定數量的股票。"某一特定價格"被稱為"授予價"或"施權價"，即根據股票期權計畫可以購買股票的價格，一般為股票期權授予日的市場價格或該價格的折扣價格，也可以是按照事先設定的計算方法約定的價格；"授予日"，也稱"授權日"，是指公司授予員工上述權利的日期："行權"，也稱"執行"，是指員工根據股票期權計畫選擇購買股票的過程；員工行使上述權利的當日為"行權日"，也稱"購買日".股票期權所規定的特定價格一般為遠低於市場價格的折扣價或約定價。
"股票期權"具有特殊內涵，不能視同"認購股票等有價證券".因為股票期權是一種權利而非義務，被授予人有選擇放棄或實施在未來獲得股票的權利，所以其收益較認購股票等有價證券更具有不確定性。
2、股票期權所得，根據財稅[2005]35號檔案規定，員工接受實施股票期權計畫企業授予的股票期權時，除另有規定外，一般不作為應稅所得；員工根據股票期權計畫選擇購買股票時，其從企業取得股票的實際購買價（授予價）低於購買日公平市場價（指該股票當日的收盤價）的差額對因特殊情況，員工在行權日之前將股票期權轉讓的，以股票期權的轉讓淨收入，作為因員工在企業的表現和業績情況而取得的與任職、受僱有關的工資、薪金所得，這部分所得一般稱為認購股票所得（行權所得）；員工將行權後的股票再轉讓時獲得的高於購買日公平市場價的差額，作為個人在證券二級市場上轉讓股票等有價證券而獲得的資本利得，這部分所得一般稱為轉讓股票（銷售）所得。
二、股票期權授予時的涉稅情況
員工接受實施股票期權計畫企業授予的股票期權時，除另有規定外，一般不作為應稅所得徵稅。
股票期權在授予時，被授予人有選擇放棄或實施在未來獲得股票的權利，所以其收益具有不確定性。
例如：某境內上市公司於2002年1月1日授予某高管人員20萬股股票期權，行使期限為3年，約定價格為當年1元／股。到了2004年12月31日，公司上市股票價格為10元／股，該高管人員可以按1元／股購進，再按10元／股賣出，從而該高管人員可獲利190萬元。如果該高管人員對該股票期權一直未行權，到了2004年12月31日，公司上市股票價格為1元／股，該經理人放棄了行使該股票期權的權利，沒有獲得利益。
三、認購股票所得（行權所得）的涉稅情況
員工對股票期權行權時，其從實施股票期權計畫企業取得股票的實際購買價（施權價）低於購買日公平市場價（指該股票當日的收盤價）的差額，是因員工在企業的表現和業績情況而取得的與任職、受僱有關的所得，應按“工資、薪金所得”適用的規定計算繳納個人所得稅；對因特殊情況，員工在行權日之前將股票期權轉讓的，以股票期權的轉讓淨收入，作為工資、薪金所得徵收個人所得稅。
實施股票期權計畫的境內企業為股票期權所得（行權所得）個人所得稅的扣繳義務人。
股票期權所得（行權所得）個稅計算方法和計算公式：股票期權形式的工資薪金應納稅所得額＝（行權股票的每股市場價－員工取得該股票期權支付的每股施權價）×股票數量股票期權形式的工資薪金應納個人所得稅＝應納稅所得額×稅率－速算扣除數舉例：某境內上市公司於2003年1月1日授予某高管人員10萬股股票期權，行使期限為5年，約定價格為當年1元／股。如果到了2006年12月31日，公司上市或股票價格上漲到5.5元／股，該高管人員按1元／股購進，再按5.5元／股賣出，獲利45萬元。根據財稅[2005]35號檔案規定，股票期權形式的工資薪金應納稅所得額為100，000×（5.5－1）＝450，000元。按照個人所得稅稅率表，適用45％稅率，速算扣除數為15，375，股票期權形式的工資薪金應納個人所得稅為450，000×45％－15，375＝187，125元。
四、轉讓股票（銷售）所得的涉稅情況
員工將行權後的股票再轉讓時獲得的高於購買日公平市場價的差額，是因個人在證券二級市場上轉讓股票等有價證券而獲得的所得，應按照"財產轉讓所得"適用的征免規定計算繳納個人所得稅。
員工將行權後的境內上市公司股票再行轉讓而獲得的所得，根據現行稅法規定暫不徵收個人所得稅。員工將行權後的境外上市公司的股票再行轉讓而取得的所得，應按稅法的規定計算應納稅所得額和應納稅額，依法繳納稅款，並由直接向個人支付轉讓收入的單位（不包括境外企業）負責代扣代繳個人所得稅；直接向個人支付轉讓收入的單位為境外企業的，取得收入的個人應按稅法規定，在規定的期限內向主管稅務機關自行申報納稅。