房租收入營業稅納稅義務發生時間的確認，應該引起稅務機關的重視。《營業稅暫行條例》第九條規定：營業稅的納稅義務發生時間，為納稅人收訖營業收入款項或者取得索取營業收入款項憑據的當天。該條規定雖然在一定程度上明確了納稅義務發生的時間，但在實際生活中，房租收入大多採取預收形式，而對預收性質的款項，《營業稅暫行條例實施細則》第二十八條規定：納稅人轉讓土地使用權或者銷售不動產，採用預收款方式的，其納稅義務發生時間為收到預收款的當天。
根據上述規定，如果稅務機關對納稅人採取在取得預收房租當天徵稅的辦法，在法律的套用上可能會有自行擴大《營業稅暫行條例實施細則》第二十八條套用範圍的嫌疑。根據財稅［2003］16號檔案第五條規定：單位和個人提供應稅勞務、轉讓專利權、非專利技術、商標權、著作權和商譽時，取得的預收性質的價款（包括預收款、預付款、預存費用、預收訂金等），其納稅義務發生的時間，按照財務會計制度的規定，以該項預收性質的價款被確認為收入的時間為準。因此，對可以分清預收房租所屬期間的，應以該價款被確認為收入的時間為納稅義務發生時間。