投資方向調節稅根據國家產業政策發展序列和項目經濟規模要求，實行差別稅率。
稅率分為0％、5％、10％、15％、30％5個檔次。分別適用於兩大類的投資項目：一類是基本建設投資，主要是新建、擴建項目；另一類是更新改造投資，主要是現有企事業單位的設備更新和技術改造項目。
1.基本建設項目投資的適用稅率。
（1）國家急需發展的項目投資，稅率為零。稅目稅率表列舉適用零稅率的有：
農、林、水利、能源、交通、通訊、原材料、科教、地質勘探、礦山開採等基礎產業和薄弱環節的部分項目投資。此外，城鄉個人修建、購買住宅的投資也適用零稅率，因為這類投資屬於個人消費行為，既有利於緩解當前居民住房緊張的矛盾，又可以減輕國家財政壓力，因此，需要要給予稅收照顧和扶持。
（2）國家鼓勵發展，但受能源交通等制約的項目投資，稅率為5％，實行輕稅政策。稅目稅率表列舉規定的有：鋼鐵、有色、化工、石油化工、水泥等部分重要原材料以及一些重要機械、電子、輕紡工業和新型建材、飼料加工等項目投資。
（3）樓堂館所項目以及國家嚴格限制發展項目投資，課以重稅，稅率為30％。
（4）稅目稅率表內未列出的基本建設項目投資，稅率統一為15％。
投資方向調節稅對基本建設投資項目按經濟規模設定差別稅率，按項目的單位工程分別確定適用稅率。具體說，對同一類型的基建投資項目，如果符合經濟合理規模的，稅率從低，予以鼓勵；如果是盲目建設的規模小、技術低、耗能高、效益差、污染嚴重的項目，稅率從高，予以限制。
2.更新改造項目投資的適用稅率。國家政策一貫鼓勵現有企事業單位走內涵擴大再生產的道路，進行設備更新和技術改造。因此，投資方向調節稅實行0％和10％兩檔稅率。凡屬國家急需發展的項目投資（與基本建設投資項目相同），給予優惠扶持，適用零稅率；其它更新改造項目投資的稅率，一律為10％。
根據稅法規定，屬於計畫外固定資產投氏釒康暮鴕願新改造為名進行的基本建設投資，稅務機關對前者除按其適用稅率徵稅外，並可以對納稅人處以應繳納稅?倍以內的罰款；對後者按照基本建設投資的稅目稅率加倍徵稅。上述項目適用稅率為零的，由計畫部門依照有關規定另行處置。至於《國家禁止發展項目表》中列舉的投資項目，則應當採取強制性措施，令其停建和沒收資金等辦法解決，不宜採取證稅等經濟手段進行調控。所以，這類禁止發展項目不適用投資方向調節稅規定。
《固定資產投資方向調節稅稅目稅率表》由國務院定期調整。