對醫療衛生機構的稅收優惠政策分為3個部分：
（1）對非營利性醫療機構的稅收政策：對非營利性醫療機構按照國家規定的價格取得的醫療服務收入，免徵營業稅。不按照國家規定價格取得的醫療服務收入不得享受此政策。
（2）對營利性醫療機構的稅收政策：對營利性醫療機構取得的直接用於改善醫療衛生條件的收入，自取得執業登記之日起3年內，經主管稅務機關審核批准後免徵營業稅。
（3）對疾病控制機構和婦幼保健機構等衛生機構的稅收政策：對疾病控制機構和婦幼保健機構等衛生機構按照國家規定的價格取得的衛生服務收入免徵營業稅。