近年來，航天企業的建設項目增多，投資金額加大，因此在內部審計時應關注這些建設項目的合理性、合規性、合法性，而招投標環節則是其中的重點。航天企業加強建設項目招投標行為的審計監督，對促進招投標的規範運作，規範項目建設秩序，確保國家建設資金得到有效運用，有著重要的作用。
航天企業除具有一般企業的特點外，還具有許多特殊性，比如：專項技術改造項目是為科研生產保駕護航的工程，質量是關鍵，而涉密項目更需要具備良好信譽的單位予以保證。
目前，對於航天系統的建設項目，內部審計起到的作用有兩方面：一是對招標起到監督作用；二是在竣工決算階段進行事後審計，找出建設過程中的問題。
招投標的審計可以起到很多積極的作用，首先，能夠幫助管理者對建設項目進行更好的控制；其次，能預防並及時制止違規現象的發生；另外，對招投標的審計是為竣工決算審計打基礎、做伏筆，可以把一個建設項目的審計連線起來，從事前到事後都有所控制，使竣工決算審計更為準確，同時也能降低審計的風險。
航天系統的內部審計部門與一般企業不同，由於涉密等原因，經常充當社會審計的角色，與被審計單位不再是單純的內部關係，還有管理、監督等方面的職責。因此，內部審計要介入建設項目招投標必須明確自身的立場，只有這樣才能確定審計目標和具體工作方法。在此基礎上，招標審計的重點也就明確了。
首先，航天系統項目建設資金除小部分自籌以外均為國家投資項目，必須進行招投標。任何形式規避招投標的行為都應及時制止。其次，由於航天企業不少建設項目涉密的特性，許多都是通過邀請投標來決定施工單位的，這使“公平、公正、公開”的原則在一開始就有了局限性。針對這一點，對於一個工程項目，尤其是對施工質量有較高要求的工程項目應該對外公開招標，對有實力的施工單位發出邀請，並對施工單位資質、規模等條件嚴格把關。鑒於工程的保密性，可以加強在政審方面的力度。另外，切實加強對建設項目招投標權力的制約和監督，避免建築工程質量低劣和“豆腐渣工程”的出現。
航天系統在今後的內部審計中，應完善建設項目全過程的審計監督程式，通過招投標審計、階段性審計、預審、竣工決算審計，形成內部審計的鏈條，強調審計的連貫性。最後形成審計報告，這也是對建設項目資料檔案的重要補充，最終形成程式檔案，做到審計工作程式和過程的規範化。