清寧丸處方為：大黃600g，綠豆25g，車前草25g，白朮（炒）25g，黑豆25g，半夏（制）25g，香附（醋制）25g，桑葉25g，桃枝5g，牛乳50g，厚朴（姜制）25g，麥芽25g，陳皮25g，側柏葉25g。
2005《中國藥典》清寧丸含量測定項下：
色譜條件與系統適用性試驗：以十八烷基矽烷鍵合矽膠為填充劑；以甲醇-0.1%磷酸溶液（85：15）為流動相；檢測波長為254nm。理論板數按大黃素峰計算應不低於3000。
供試品溶液的製備：取本品水蜜丸，研細，取約0.1g，精密稱定，置錐形瓶中，精密加鹽酸-乙醇（1：25）混合溶液25ml，稱定重量；或取重量差異項下的大蜜丸，剪碎，混勻，取約0.3g，精密稱定，置燒杯中，加水3ml，置水浴溫熱並攪拌使溶解，加硅藻土0.5g，拌勻，置100℃烘箱中，烘乾，轉移至錐形瓶中，並用水3ml洗滌燒杯及玻棒，洗液併入錐形瓶中，置100℃烘箱中，烘乾，精密加入鹽酸-乙醇（1：25）混合溶液25ml，稱定重量，超聲處理（功率300w，頻率50khz）10分鐘，置水浴加熱回流2小時，放冷，再稱定重量，用鹽酸-乙醇（1：25）混合溶液補足減失的重量，搖勻，濾過，精密量取續濾液5ml，置蒸發皿中，蒸乾，殘渣加甲醇適量使溶解，轉移至5ml量瓶中，加甲醇稀釋至刻度，搖勻，濾過，取續濾液，即得。
祝明等用分光光度法測定清寧丸中總蒽醌的含量，測定波長為513nm。
周寶寬等用hplc法測定莫家清寧丸中大黃酚的含量。儀器：日立665 a-11型高效液相色譜儀。色譜柱為discovery c18 calumn, 25cm×4.6mm, 5μm；流動相：含1g/l 高氯酸的甲醇-水(80：20)溶液；流速1.0ml/min；檢測波長：254nm。