1、享受繼續教育和不斷提高執業水平的權利
執業藥師繼續教育是不斷提高執業藥師藥學專業素質、法律和道德素質、執業能力和藥學服務質量的必要手段。為使執業藥師逐步適應以消費者和病患者為中心，開展藥學服務的需要，須進一步加強執業藥師繼續教育，不斷提高執業藥師隊伍的整體素質。
近年來，隨著執業藥師數量的逐年增多，執業藥師對繼續教育的內容和形式提出了新的更高要求，而現實中執業藥師繼續教育的內容和形式缺乏選擇性，工學矛盾和經濟負擔重的問題也日益突出，廣大執業藥師有權利呼籲對繼續教育的內容和形式進行進一步的改進。
2、獲得參加繼續教育保障條件的權利
根據《執業藥師繼續教育管理暫行辦法》第二十五條的規定，執業單位應為執業藥師提供學習經費、時間和其他必要條件。執業藥師參加繼續教育所需經費應從本人工作單位職工教育經費中報銷。執業藥師參加繼續教育期間的工資、福利待遇等按國家有關規定執行。
3、拒絕亂用政策、權力的權利
2003年11月3日，sfda在關於印發執業藥師繼續教育管理暫行辦法的通知（國食藥監人[2003]298號）中宣布：在印發新修訂的《執業藥師繼續教育管理暫行辦法》的同時， 2000年8月印發的《執業藥師繼續教育管理暫行辦法》（國藥管人［2000］334號）同時廢止。
因此，對於利用已廢止的辦法中的與新修訂的辦法相牴觸的或新修訂的辦法沒有規定的條款限制執業藥師在繼續教育方面權利的做法，執業藥師有權利拒絕執行。
根據《執業藥師繼續教育管理暫行辦法》第二十四條的規定，施教機構收取學習費用必須合理，應減輕執業藥師的經濟負擔，不得以盈利為目的。執業藥師有權監督、投訴繼續教育過程中的不合理收費現象。
4、無論是否註冊都有享受繼續教育的權利
根據《執業藥師繼續教育管理暫行辦法》第三、四條的規定，執業藥師繼續教育對象是針對已取得《中華人民共和國執業藥師資格證書》的人員，內容主要包括有關法律法規、職業道德和藥學、中藥學及相關專業知識與技能，並分為必修、選修和自修三類。
接受繼續教育是執業藥師的義務和權利。取得《執業藥師資格證書》的人員每年須自覺參加繼續教育，並完成規定的學分。同時，各有關部門應積極支持、鼓勵執業藥師參加繼續教育。
5、選擇繼續教育內容、形式和手段的權利
根據《執業藥師繼續教育管理暫行辦法》第五條的規定，各省、自治區、直轄市食品藥品監督管理部門應充分發揮現有藥學教育資源的作用，為執業藥師提供更多的選擇範圍和便利條件。
根據《執業藥師繼續教育管理暫行辦法》第十五條的規定，執業藥師繼續教育的形式和手段可根據實際靈活多樣，可採取網路教育、遠程教育、短期培訓、學術會議、函授、刊授、廣播、視像媒體技術、業餘學習等多種形式。因此，執業藥師有權利在上述繼續教育形式和手段中作出自己的選擇。
根據《關於改革和加強執業藥師繼續教育管理工作的意見》的規定，在規定的範圍內，執業藥師可以自行選擇接受繼續教育的形式，自行選擇選修內容，自行決定自修內容和自修方式。
各級藥品監督管理部門、執業藥師繼續教育實施機構不應以各種形式和名義限制執業藥師的上述選擇權。
6、要求繼續教育內容水平與針對性的權利
根據《執業藥師繼續教育管理暫行辦法》第十一條的規定，執業藥師繼續教育的內容要適應執業藥師工作崗位的實際需要，注重科學性、先進性、實用性和針對性，適應執業藥師提供高質量藥學服務的基本要求。因此，執業藥師有權利對繼續教育內容的水平、針對性提出要求和建議。
7、選擇繼續教育選修、自修內容的權利
根據《執業藥師繼續教育管理暫行辦法》第十三條的規定，選修內容是按照《全國執業藥師繼續教育指導大綱》的要求，執業藥師可以根據需要有選擇地進行更新、補充的繼續教育內容。
每個年度的面向全國的選修內容由中國執業藥師協會遴選、論證、確認後公布。在公布的繼續教育選修內容範圍內，在完成規定的選修學分情況下，執業藥師有權利自行選擇選修內容的學習。
根據《執業藥師繼續教育管理暫行辦法》第十四條的規定，自修內容是按照《全國執業藥師繼續教育指導大綱》的要求，執業藥師根據需要在必修、選修內容之外自行選定的與執業活動相關的繼續教育內容。因此，執業藥師有權利在《全國執業藥師繼續教育指導大綱》要求的範圍內自主選擇繼續教育自修內容。
8、選擇繼續教育自修形式的權利
根據《執業藥師繼續教育管理暫行辦法》第十四條的規定，自修的形式可以靈活多樣，如參加研討會、學術會，閱讀專業期刊，培訓，學歷教育，講學，自學，研究性工作計畫、報告或總結，調研或考察報告等。因此，執業藥師有權利在上述自修形式中自主作出選擇。
9、可累計獲得繼續教育自修學分的權利
根據《執業藥師繼續教育管理暫行辦法》第十七條的規定，自修內容學習可累計獲取學分。
10、獲得繼續教育學分並在全國有效的的權利
根據《執業藥師繼續教育管理暫行辦法》第十九條的規定，具有執業藥師資格的人員參加必修內容和選修內容的學習並經考核合格後，由施教機構授予規定的學分，並在《執業藥師繼續教育登記證書》上確認與登記蓋章。
根據《執業藥師繼續教育管理暫行辦法》第二十條的規定，採取網路教育、遠程教育形式實施必修、選修內容，並經考核合格的，由施教機構出具《執業藥師繼續教育學分證明》，各省、自治區、直轄市食品藥品監督管理部門憑此證明在《執業藥師繼續教育登記證書》上進行學分登記。
根據《執業藥師繼續教育管理暫行辦法》的規定，執業藥師參加《執業藥師繼續教育自修內容學分授予表》所列的活動，在提供參加活動證明後，經各省、自治區、直轄市食品藥品監督管理部門人事教育部門或由省級食品藥品監督管理部門委託的機構確認，有權獲得規定的繼續教育自修學分。並在《執業藥師繼續教育登記證書》上進行學分登記。
根據《執業藥師繼續教育管理暫行辦法》第二十二條的規定，執業藥師參加必修內容、選修內容及自修內容繼續教育獲取的學分在《執業藥師繼續教育登記證書》上進行登記後在全國範圍內有效。