3、認識不足，政府扶持力度不夠。由於農民的市場意識不強，一家一戶生產經營已成習俗，對農村專業合作組織缺乏認識，加之各級各部門對農村專業合作組織的扶持力度不夠，因此發展緩慢。
四、對我縣農村專業合作經濟組織發展的意見。
農村專業合作組織的產生和發展，在推進農業產業化經營的持續、穩定、健康發展的進程中擔當著極為重要的角色，能有效滿足了農民致富的需要，增強了農民市場競爭能力。它是聯繫農民走向市場的紐帶，是連線農民與科研、教學、農技推廣單位的橋樑，是農業社會化服務體系的一支新生力量，已經成為“高產、優質、高效”農業的一種新的組織載體。但從我縣的情況看，發展還處於初始階段，還存在不少困難和問題，要大力發展農村專業合作經濟組織，順應市場經濟的蓬勃發展。在此除了農業部門的技術指導、信息提供，和專業合作經濟組織的自我建設、自我強大以外，急需各級政府和有關部門加強指導和扶持。1、用現代企業觀念建設專業合作經濟組織，將組織公司化、機構規範化、運作合理、合法化。現代企業觀念要求政企分開，把專業合作經濟組織納入社會市場經濟的大範疇，以需求為導向，並不斷完善自身的機構設定和組織規範。專業合作經濟組織一定要在自身運作上嚴格監督制度，組織的重要決定要集思廣益，注重民主。
2、鼓勵有條件的農村專業合作經濟組織興辦經濟實體。在業已形成的主導產業中，圍繞加工、銷售等環節興辦經濟實體，是增強農村專業合作經濟組織服務實力的有效途徑。興辦小型銷售或加工實體可充分利用會員的分散資金設備和剩餘勞動力，增加農產品的附加值；減輕組織原材料供應不穩定、成本高的困難；又增加了積累，改善了條件，提高了服務能力和服務水平，使服務由生產經營中的某個環節，逐步向產前、產中、產後各個環節延伸，實現全方位、系列化服務。
3、建立健全利益機制，激發組織活力。利益驅動是市場經濟的一般規律，農業微觀經濟組織的建設是農業市場化的主要內容，多元化組織的參與主體都是以追求自身利益最大化的經濟目的而來的。所以必須處理好諸多參與主體的利益分配關係，形成一種相輔相成、互相有利的利益機制。這種利益機制還要擴展到組織內部，比如把組織的產品銷售量與各成員的利益聯繫起來，按銷售額提成，多銷多得，調動廣大成員的積極性。
4、要強調“堅持一個基礎，保障‘三民’原則”
政府在引導農村專業合作經濟組織發展過程中，始終要把它作為廣大農民在自願、互利基礎上建立起來的經濟合作組織，農戶入會自願、退會自由、管理民主。按“民辦、民管、民受益”的“三民”原則，制定符合廣大農民實際特點和需要的一些管理制度，使專業合作經濟組織成為一個利益共同體，既有凝聚力和活力，又增強其參與市場競爭的能力。
6、制定其他優惠扶持政策
一是在土地承包方面。鼓勵農戶間進行合理的土地流轉，使農業生產規模化，集約化，鼓勵農戶用土地入股成為農村專業合作組織的一員;二是人力支持。在現代市場經濟條件下，任何產業、組織都必須加大自身的科技含量，要有現代行銷的觀念。政府鼓勵廣大專業人士置身於農村合作組織組織的建設中。專業人士不僅要有農業科技人員，還應有高級管理人員、行銷策劃人員、有超前意識的人才。建立工作補償制度，並把對這種專業人員的補償或獎勵與其業績相掛鈎;三是稅收支持。1994年我國財政部、國家稅務總局已對農村專業技術協會、專業合作化等作出了規定：“對其提供的技術服務或勞務所得的收入……，暫免徵收所得稅。”，鼓勵一部分有條件的農村專業合作經濟組織興辦了一批小型經濟實體。我縣農村專業合作經濟組織正在起步，就更需要縣財政在稅收這一方面的支持、優惠;四是資金支持。各級政府要充分利用國家扶貧資金、項目資金、貼息貸款等優先安排給農村專業合作組織的農戶使用。各金融部門也要積極支持農村專業合作組織的發展，在貸款上給予優惠和照顧。