其次是合理輪作壓力逐年增大。由於近幾年茶葉、泡核桃和甘蔗的種植效益逐年增加，基本煙田被逐漸蠶食，輪作比例隨著其它產業的發展而逐年下降，特別是隨著烤菸種植比較效益的下降，原計畫逐年增加本地水旱輪作比例難以實現。隨著輪作比例的下降，土壤中病原物基數越來越大，病毒病發生的隱患越來越大。必須從政策層面解決烤菸種植比較效益下降的問題，採取行政和經濟措施相結合的辦法保護基本煙田，確保合理布局、科學輪作措施的落實。
總之，通過各級各部門的共同努力，該縣在烤菸病毒病的綜合防治方面取得了一定的成績，但是必須清醒的看到存在問題和隱患，在今後的工作中發揚成績、克服不足、消滅隱患，確保本地烤菸產業的可持續發展。