機關黨總支書記在院黨委和黨總支委員會的領導下，全面主持總支工作。主要職責有：
一、圍繞院黨委的中心工作和任務，具體規劃、制定總支工作的年度和學期工作要點、計畫安排，並負責組織實施，督促做好年度學期的工作小結。
二、負責制定學習計畫，組織安排機關黨員和幹部學習黨的基礎知識和基本理論，學習黨的有關會議精神、決議和黨的路線方針政策。
三、積極協調機關黨、政、工、團等方面的關係，保證機關黨政工作任務的順利完成。
四、負責主持總支委員會或總支擴大會議，討論、研究和決定各種黨務工作問題。積極組織黨員和職工開展各種有益的活動。
五、負責搞好黨總支和黨支部的思想建設和組織建設，對黨員進行黨性、黨風、黨紀和黨員標準的教育，充分發揮黨支部的戰鬥堡壘作用和黨員的先鋒模範作用。
六、做好預備黨員的轉正和發展新黨員的工作，保證發展質量。
七、協助抓好機關作風建設，深入基層，深入民眾，深入實際，做好經常性的思想政治教育和調研工作，調動機關工作人員的積極性和創造性，增強機關黨組織的凝聚力。
八、積極配合行政主管部門搞好機關黨員幹部和工作人員的考核、民主測評等項工作。