江西中醫學院學生會是在學校黨委的領導下，校團委的指導下，建立的青年學生的民眾性自治組織。設有主席團、辦公室、紀檢部、宣傳部、文藝部、體育部、權益生活部、學習部、心理保健部、社會實踐部、精神文明督察隊、國旗班、學生社團聯合會、青年志願者協會、學生宿舍自律委員會15個職能部門。
一、主席團
1.統籌安排各部門開展具體工作；2.擬訂學生會各類制度和年度、學期的工作計畫及工作總結； 3.籌備並舉辦江西中醫學院學生代表大會；4.按時完成學校黨委、團委安排指導的各項任務，加與學校各相關部門的聯繫與溝通；5.指導各院學生會開展工作；6.促進學校領導與學生的交流和溝通。
二、辦公室
1.負責管理學生會日常經費與固定財產，負責學生會檔案的收集和整理；2.與主席團配合，負責對學生會的日常工作進行安排，負責學生會各類制度的草擬、初審；3.負責對各院學生會的評優評先工作；4.負責學生會各類信息的上傳下達；5.負責學生會幹部的各類培訓；6.指導、參與、協助各校相關部門的工作。
三、紀檢部
1.負責監督落實學生會的各項制度；2.負責日常各類工作完成情況的督促和工作人員的考評；3.定期向主席團匯報工作，將相關人員及事務的處理意見上交主席團，並由主席團進行裁決4.負責學生會人事檔案管理，完善入會和退會管理制度。
四、宣傳部
1.傳達學校黨委、團委的各種精神和決議；2.協助學生會其他部門的活動宣傳工作；3.領導和團結各學院學生會宣傳部共同致力於學生會宣傳事業的發展；4.開展特色活動促進學校文化建設；5.負責對學生會的各類活動進行新聞報導等宣傳；6.聯繫校內外宣傳力量（廣播站、記者團及其他兄弟高校宣傳機構），宣傳校園文化。
五、文藝部
1.開展各種符合我校特色的文娛活動；2.加強與校內外文藝組織的聯繫；3.指導、參與、協助各院相關部門及社團的工作。
六、體育部
1.積極開展各種民眾性體育競技活動，致力於我校體育事業的發展；2.配合學校其他部門開展體育活動；3.指導、參與、協助各院相關部門及社團在校內、外的體育工作。
七、權益生活部
1.深入了解全校學生生活中存在的問題並及時向有關部門反映，積極倡導健康向上的校園生活理念；2.維護學生的正當權益；3.做好學生代表大會提案的反饋工作；4.指導、參與、協助各院相關部門的工作。
八、社會實踐部
1.提出學生社會實踐的總體方案並論證其可行性，走社會實踐與經濟研發相結合的道路；2.創造、提供條件使學生有更多接觸社會的機會；3.協助招生就業辦工作，讓同學們充分了解擇業、就業的相關信息；4.指導、參與、協助各院相關部門的工作。
九、學習部
1.引導廣大學生努力學習，幫助學生全面發展，進一步促進我校良好學習氛圍的形成；2.領導和團結各院學生會學習部共同致力於我校學生學習和科技創新能力的提高；3.組織各種有助於提高我校學生學習和科技創新能力，激發學生學習興趣的活動；4.致力於師生間的學術交流；5.指導、參與、協助各院相關部門的工作。
十、心理保健部
1.提高廣大大學生的心理素質，進一步健全大學生人格，完善大學生知識結構，以服務同學為己任；2.以“學習、宣傳、研究、增進心理健康”為宗旨，積極開展各種心理活動；3.配合人文學院心理諮詢中心的相關活動；4.指導、參與、協助各學院相關部門工作。