信息技術系1995年開辦，現有計算機軟體技術（軟體java方向、3g移動軟體、軟體服務外包）、計算機網路技術、動漫設計與製作、廣告設計與製作、計算機套用（計算機信息管理方向）五個專業，在校學生700餘人。
系辦公室是系行政領導的辦事機構，在系主任的領導下工作。主要協助系主任處理本系行政事務，了解全系的工作動態。
負責做好本系國家職業技能鑑定有關宣傳發動、考試、考核等工作。
負責草擬全系檔案、材料及上報下發有關檔案。做好系部會議的會務準備和各部門綜合協調工作。
負責信訪接待工作及電報電話、信函、郵件、雜誌、圖書、報表等工作。
辦理學院和系部交代的其他工作。
湖南生物機電職業技術學院軟體外包3g移動開發就業優勢明顯。該專業是有國家雙軟認證企業歐柏泰克和湖南生物機電學院聯合打造。學生一邊可在學習理論知識，一邊可在軟體企業進行項目實訓，得到一線研發工程師的指導和培養，積累豐富的工作經驗，使學生的技能能夠和企業良好對接，實現學生學的知識是企業需要的知識，在就業方面更具競爭力，並且有人力資源公司，軟體科技園就業三重保障。