鄉鎮人民政府負責全鎮垃圾整治工作，按規劃建設垃圾中轉站(總收集點)建立垃圾清運保潔制度，負責全鎮垃圾中轉站(總收集點)的垃圾收集清運及集鎮保潔、負責轄區環境衛生的監督管理。
村委會按照“一事一議”的要求，組織村民進行村莊垃圾整治，建立垃圾清運保潔制度，制定實施村莊垃圾整治的村規民約，設定垃圾收集點，負責專業保潔員隊伍的建立，負責本村範圍內農戶、企事業單位的垃圾收集清運和公共區域保潔。
3、制定收費方法和政策，多方進行扶持
各鄉鎮人民政府要制定可操作性強的管理制度。在農村垃圾處理費徵收管理規定出台前，可按照“一事一議”的原則或協調村老協會，按照本村垃圾收集運輸等實際開支情況，酌情徵收衛生費，保證工作的正常進行。1、建制鎮建成區可參照*政綜[XX]175號檔案《**市城市生活垃圾處理費徵收管理暫行規定》和縣城區生活垃圾處理費徵收標準執行。2、村莊每人每月徵收1-2元，企事業單位按人數每人每月徵收0.5-2元，商店按每店每月徵收10-30元，建築垃圾按每平方米徵收1元垃圾處理費標準執行。各級財政要對農村垃圾的處理給予貼補，特別是經濟比較困難的鎮村要給予重點扶持。市計畫對積極開展垃圾整治，經各級驗收合格的的村莊平均每年每村給予1-2萬元的補助，縣也要給予配套撥補。3、垃圾清掃及清運。①清掃：房前屋後由住戶負責;村道、溝渠和綠化帶的衛生與白色污染由保潔員負責;各住戶的生活垃圾由保潔員每天定時收集，要求保潔員對垃圾適當分類，對泥土和樹枝、樹葉就地處理;②清運：a:首批開展75個村的垃圾：**、**運往莆田大湖垃圾處理場;**\**運往蒲峰填埋場;b:以鄉鎮為單位：按照市場化運作原則，建立清運隊伍，要求各鄉鎮配備2-5部清運車，當天垃圾當天清運、防止“滴、灑、漏”現象。
4、強化考評督查，確保整治實效
農村垃圾整治必須實行目標責任制，要層層建立年度目標責任制和督促、協調工作機制，強化領導責任制的落實，整治成效的考評要納入年終統一考核內容，作為評先、評優和獎勵的依據。要求各鄉鎮每月定時或不定時自查，建立月報季度。縣建立抽查及定時檢查辦法，並建立動態管理制度。考評好的給予表揚獎勵，達到“垃圾整治示範村”標準的，經驗收合格，將給予一定資金獎勵，並予以表彰。對垃圾整治不力的村鎮將予通報批評並不得參加“文明村鎮”、“環境優美鄉鎮”、“生態村鎮”的評選，並對主要責任者進行效能警告。
5、加強協作，齊抓共管。
農村垃圾整治工作是項系統工程，各部門要各司其職，密切配合，整合力量，集中扶持。縣建設局負責研究制定、收集垃圾處理費徵收等相關政策，進一步協調加快農村垃圾收集設施建設，認真落實首期75個村莊垃圾的整治工作，並抓好工作督查;縣委宣傳部負責對農村垃圾整治工作的輿論宣傳工作;縣環保局負責日常執法監督，嚴厲打擊亂倒亂燒工業邊角料行為;縣愛衛生負責治理農村衛生髒、亂、差問題，制定農村衛生環境綜合整治方案，並組織實施;縣水利局牽頭開展境內水域的綜合整治;縣委文明辦負責“三講一樹”活動和文明創建工作的指導協調，並組織對農村垃圾整治工作的評比等工作。各級各部門把農村垃圾整治工作當作第三批先進性教育中為民辦實事的重要內容來抓。把農村垃圾整治工作與農村公路工程、水利工程、造福工程、舊村整治、村鎮住宅小區建設、創建文明村鎮、生態村鎮等工作有機結合起來，整體推進農村基礎設施和環境建設。