衛生系統積極加強集貿市場食品衛生質量監測，在全市15個區縣（市）40個集貿市場開展糧油食品、肉製品、醃臘製品、調味品、保健食品等30餘類商品衛生質量免費監測。專項整治工作以來，已對5個集貿市場的大米、小食品、蔬菜、醬油等29類食品987件進行了抽樣監測，合格率達89.12%。向社會公告了12期集貿市場食品衛生質量。4至8月在全市集貿市場中集中開展了食品衛生專項整治，檢查綜合市場和批發市場672個，檢查
食品經營戶13927戶，責令停止生產經營的61戶，吊銷衛生許可證的4戶，查處和銷毀不符合衛生要求和假冒偽劣食品20噸，取締集貿市場及周邊地區食品生產加工黑窩點31個，罰款25.92萬元。目前全市各區縣已分別建立了2—3個食品經營示範市場。
（四）整頓藥品流通秩序，強化中藥材市場監管
市藥監局在徹底關閉了南岸區南坪二貿易區藥品集貿市場的基礎上，大力整頓藥品流通秩序，取締非法藥品經營活動，嚴厲打擊制售假冒偽劣藥品的違法犯罪行為，重點整治重慶中藥材專業市場及周邊藥品經營戶，促進中藥材市場的規範經營。在專項整治工作中，印發了《整頓南坪地區藥品流通藥品流通秩序的通告》，責令無證照藥品經營者停止一切非法經營活動，做到撤貨、關門、走人、轉向。同時，採取由藥監、工商、公安等部門組成的聯合執法隊伍反覆地對城南大道、金山支路、裕佳花園等地區開展重點執法檢查與設定聯合執勤點蹲點，執法與巡查相結合的辦法開展專項整治，使違法經營戶既無法開門營業也不能暗地經營，並及時查獲了一大批違法經營的藥品，查封了一批非法藥品庫房。另外，還發動民眾舉報，收到24件舉報線索，在公安機關配合下，以查戶口方式查獲了一批設在民宅中的非法藥品倉庫。通過專項整治，共取締非法經營、掛靠經營藥品戶153戶，查處違法經營、假劣藥品案24件，沒收藥品標值110萬元，罰款56.95萬元。
針對國家藥監局對重慶中藥材市場藥材質量抽驗，抽檢品種95.1%為不合格，以及市場周邊設定共40多個未經批准且不符合要求的藥品庫展和經營門店，對中藥市場的生顧構成了極大威脅的實際情況，在渝中區政府統一領導下，成立了整頓中藥材市場領導小組及辦公室，組建了以市藥品稽查總隊、醫藥監分局、工商、公安、物價、衛生、城管等部門為主體的聯合執法隊伍武藝中藥材市場衣周邊經營門店的專項整治工作，發布了整治通告，對市場內的藥材經營戶重新登記，組織360名從業人員進行健康體檢和上崗業務培訓，對165戶經營戶核發了《重慶中藥材市場準入證》，建立了《違法違規記錄》，藥監分局在市場內設立辦公室，加大了監管力度。取消了市場周邊21戶經營藥品的資格，對3家醫療器械、24家保健食品經營門店加強了監督檢查，嚴查超範圍經營藥品行為。通過專項整治，共取締非法經營戶3戶，查處違法違規經營44起，沒收違規經營和偽劣藥品、醫療器械、保健品、性保健用品488種，價值11萬元；查封無證經營的藥品庫房7個，貨值130餘萬元。經國家藥監局XX年抽檢，其抽檢藥材品種合格率由4.9%上升到67.5%，超範圍經營中西成藥得到有效遏制；95%的藥材使用了物價局統一標價簽，從業人員佩證上崗，經營秩序有所
好轉。