4、簽發文：一般性函件，由辦公室收簽分發。來函和發函均要進行登記，以便查考。以中心名義發出的檔案，擬稿後先交辦公室修改後，送中心領導簽發。
5、印發文：發文由起草科（室）負責校對，列印和校對檔案必須認真負責，印前對修改的檔案應認真複查；對於重要發文，辦公室在蓋章分發前須再次核查，防止差錯。
6、立卷歸檔：對具有保存和利用價值的各類檔案，辦理完畢後，最遲於次年第一季度，按規定立卷歸檔。單項業務性檔案由各主管科（室）保管，綜合性和密級以上檔案由檔案室或專職人員管理。
7、清理檔案：對於沒有保留利用價值的檔案，在辦理結束後，最遲於次年第一季度，經挑選、覆核登記，呈領導審查批准，指定人員負責監督燒毀。
六、請示報告制度
1、實行逐級請示報告制度，對上級下達的工作任務執行情況要及時報告。
2、各科（室）外出參加會議和重要業務活動後要及時匯報。發生重大疫情及職業中毒、食物中毒事件，及時向上級請示報告，並提出建議和辦法並及時採取措施，專題調查和科學實驗結果要向上級作書面報告。
3、經費管理：超過中心本職權範圍的財務開支，要先報上級審批，中心內的各項開支由中心主任批辦執行。
4、疾病預防控制用藥品、器械、裝備、生物製品和辦公用品的採購要報告審批。
5、在工作中遇到涉及政治、方針、政策、法律、經濟等方面問題，要及時向上級請示報告。
七、清潔衛生制度
1、由中心辦公室負責對本中心環境美化與清潔衛生的安排、督促和檢查工作。
2、實行清潔衛生分片包乾制，明確責任，樓內堅持每天清掃，院內每周進行清掃，確保環境清潔。
3、堅持經常性與突擊性相結合，每日小掃，每周大掃，節日前開展突擊活動。
4、實行每月檢查，每季度評比競賽，公布結果，表彰先進。
八、現場工作制度
1、長時間現場工作，目的要明確，內容要具體。
2、認真做好組織工作，人員要統一指揮，密切配合，互相尊重，搞好團結。
3、有認真負責和
實事求是的工作態度。
4、遵守操作規程，做好個人防護。
5、調查工作做記錄和標本採集要詳細。
6、尊重當地風俗習慣，密切黨群關係、幹群關係。
7、工作結束後要做好資料分析，寫出書面工作報告。
8、撤離現場前要向當地領導匯報。
9、短期現場工作與外勤工作要作好報表記錄。
九、差錯事故處理制度
1，凡因工作不負責任，不遵守規章制度，違反操作規程而使工作造成不良後果者，按情節輕重和危害程度的不同，列為差錯或事故。
2，差錯或事故發生後，應及時報告領導及有關部門，並須迅速採取有效措施，儘量減少損失。
3，凡已積極採取措施，但因技術水平和設備條件的限制，無法防止而產生不良後果者，不按事故和差錯處理。
4，對每起事故和差錯，要進行登記、報告、實事求是地弄清情況，找出原因，制定對策，防止再發生。
5，處理事故和差錯，本著教育為主，按事故情節、本人態度、一貫表現和造成的後果等情況，給予批評教育、紀律處理、經濟處罰，情節惡劣、後果嚴重、構成犯罪的移交法務部門處理。