第三階段：整改提高階段，9月下旬至10月中旬（25天左右）。
1、制定落實整改措施。著眼於全縣經濟社會快速發展的宏偉目標，立足於創造性地做好本地本單位的工作，致力於調動每位黨員的工作積極性和創造力。針對黨員個人、基層黨組織和領導機關查找出的突出問題，分別制定整改措施。（1）每個黨員根據自己存在的問題和黨組織的評議意見，制定整改措施；（2）領導機關、基層黨組織針對自身和黨員隊伍中存在的問題，制定整改方案，並交黨員大會討論通過；（3）堅持邊學邊改、邊查邊改、邊整邊改。從教育活動一開始，就要針對民眾反映強烈的突出問題。從民眾最急、最盼、最難、最怨的事情做起，從黨員自身做起，立說立行，見諸行動。同時，要努力解決影響改革發展穩定的突出問題。解決好黨員和黨組織存在的突出問題。制定整改方案，要突出整改重點，細化整改措施，落實整改責任，明確整改時限，加強考核監督，確保整改措施落到實處。要堅持上下聯動整改，以下促上，以上帶下，上下聯動，提高整改的整體效果。上級機關和黨員領導幹部帶頭制定整改措施，把增強立黨為公、執政為民意識作為整改的重點，把提高領導水平、執政能力作為整改的著力點，把解決黨風、政風、行風和工作作風方面的突出問題作為整改的突破口，認真進行整改，為下級機關和其他黨員作出表率；（4）抓好整改措施的落實，鞏固教育活動的成果，讓民眾實實在在地感受到教育活動帶來的變化和進步。教育活動基本結束時，要通過召開有關會議，在一定範圍內公布等適當方式向單位和黨員幹部民眾通報整個教育活動情況，並採取民眾代表評議和在民眾中隨機抽樣調查等形式，對各單位黨組織的先進教育活動情況組織一次民眾滿意度測評。多數民眾不滿意的要及時“補課”。
2、檢查梳理整改措施落實情況，鞏固擴大教育活動成果。集中學習教育基本結束後，要用三個月左右的時間，切實做好鞏固和擴大教育成果的工作。（1）要檢查梳理整改措施落實情況。對應當解決而沒有解決的問題，要集中力量切實解決；對暫時解決不了的問題，要向民眾作出說明，並創造條件儘快解決；整改效果不好、多數民眾不滿意的，重新進行整改。（2）表彰和宣傳優秀黨員。對先進基層黨組織和優秀共產黨員，採取一定方式進行表彰，大張旗鼓地進行宣傳，弘揚正氣，激勵先進。（3）加強教育轉化、妥善處置不合格黨員。這次教育活動，不單獨搞一個組織處理階段。對那些不履行黨員義務、不具備黨員條件的，要多做教育工作，促使他們儘快轉化為合格的共產黨員，對經教育不改、不符合黨員條件的，要根據黨章和有關規定，按照正常程式進行處理。對違紀黨員，要按照《中國共產黨經律處分條例》的規定，給予紀律處分。
3、繼續開展主題活動，健全各項工作制度和長效機制。要把落實整改措施與全面推進基層黨組織建設和黨員隊伍建設有機結合起來，深入紮實地開展前面安排部署的各項主題活動。（1）對在集中學習階段安排部署的爭當“五個表率”黨員幹部、開展“五比五爭”，爭當“五好”黨員活動、爭創“五個好”基層黨組織、爭創“五型”鄉鎮機關活動進行總結評比，並對開展以上四項活動的方案進一步修改完善，使其形成長效機制，長期堅持下去。（2）要進一步健全完善“三會一課”、民主評議黨員、黨員目標管理等行之有效的黨員教育管理制度。重視入黨積極分子的培養，對發展對象實行黨員和民眾代表“雙推一公開”制度，嚴把黨員“入口”關，確保新發展黨員的質量。制定黨員教育培訓規劃，建立激勵機制，不斷提高黨員素質。完善監督約束機制，進一步疏通“出口”，對不合格黨員及時進行組織處置。結合先進性教育活動，建立全縣黨員信息管理系統，逐步實行規範化管理。