2、農村財務管理制度混亂，給違法犯罪者提供可乘之機。村制度不健帳目不清是個突出的問題，主要表現是有的村“一把手”直接兼任會計、出納，財權主要掌握在村支書和村主任手中，收支全憑“一枝筆”、“一張嘴”。有些村經手財務的人員分散，人人收錢，人人花錢，各自為政，一手拿條子，一手拿票子，常年不報帳。有的村財務收支沒有專人審批把關，村幹部人人自報自批，開支隨意，項目、標準、限額沒有明文規定，責權不清，管理上的漏洞為職務犯罪大開方便之門。
3、財會人員素質低下，不能發揮管理作用。的有村在財務人員的任用上不是看其業務素質高低，而是任人唯親，找關係戶，拉私情網，看其是否聽話，否則就隨意撤換，“頂的住的站不住，站的住的頂不住”，財務隊伍不穩定。而一些財會人員文化水平低，沒有受過專門培訓，沒有財會基礎知識，不懂帳理，胡亂下帳，形成“抽屈帳”，“包袱帳”、“口袋帳”。在財務管理環節上，不堅持原則，不嚴格把關，對村財務主管言聽計從，對違法犯罪現象不抵制甚至同流合污，根本起不到當家理財的作用。
4、缺乏監督制約機制。目前農村基層政權在運行過程中，存在許多體制和制度上的缺陷，權力的行使缺乏必要的監督和制約，有些村大事小事個別人說了算，規章制度形同虛設，缺少民主監督；有些村村務不公開或公開不實，村幹部暗箱操作，不願接受民眾監督；有些村對村財鄉管制度落實不認真，流於形式;有關部門對農村財務制度的執行情況監督檢查不到位。村級財務管理缺乏監督制約，客觀上使違法犯罪現象得以滋生和蔓延。
三、預防農村幹部職務犯罪的主要措施
1、加強對農村幹部的培訓力度，不斷提高其依法行政的能力。
農村由於條件所限，黨員幹部學習機會不多，自覺學習的積極性不高，這樣勢必造成他們放鬆世界觀的改造，放鬆對黨的方針、政策、法律、法規的學習，一旦走上領導崗位，政治上的不成熟，法律意識欠缺就顯現出來。為此，檢察機關要積極配合組織、宣傳、黨校等各部門，充分發揮職能作用，採取任前培訓、定期輪訓、農閒整訓等形式，加大對農村幹部的培訓力度，提高其政治業務素質，增強其學法用法的自覺性，以適應新形勢下農村工作的需要。
2、面向農村，開展法制宣傳，發揮民眾反腐敗的積極性。
人民民眾對腐敗現象深惡痛絕。檢察機關要利用檢務公開，送法下鄉，入戶走訪等項活動進行多種形式的法律宣傳，把法律交給民眾，通過宣傳，使廣大民眾認識到職務犯罪的危害，用法律武裝民眾頭腦，提高民眾的法律水平，鼓勵民眾積極舉報違法犯罪分子，讓廣大民眾監督農村幹部的言行，使之時刻想到法律的威嚴，不敢擅越雷池。
3、加強農村財務人員管理工作，提高業務素質。
各村要配齊財會人員，杜絕村支書、村主任兼任會計、出納的現象。要保持財會隊伍的穩定和財務工作的連續性，改變“幹部換、會計變”的用人現象。財務人員要理直氣壯地參與財務管理和決策，發揮好管理監督職責。有關部門要把農村財務人員業務培訓納入工作計畫，通過學法規、學業務，提高自身素質，努力培訓一支業務精熟，堅持原則，秉公辦事的農村財會隊伍。