第二，構建科學的制度是提高黨建整體效果的必要保障。十一屆三中全會以後，我們黨就提出要走制度建黨的道路。用科學的制度推進黨的建設，是xx屆四中全會對黨的建設的新要求。科學的制度首先是一個系統。制度是由全部制度要素連線起來的。用科學的制度加強黨的建設，需要在黨的思想建設、組織建設、作風建設和反腐倡廉建設中提煉製度要素，並通過相互連線而成為一個系統。這樣，黨的建設才能在整體上取得效果。其次，科學的制度需要注意實體制度與程式制度的統一。黨內的實體制度是黨的制度體系中的主幹，但實施實體制度需要相應的程式制度來保證。因此，用科學制度實施黨建的新部署，既要完善實體制度，更要構建程式制度。最後，科學的制度需要強有力的執行來保障。制度是正規則。如果沒有強大的執行力，黨內的潛規則就會發揮作用。當前黨內的制度體系已經建立，關鍵是提高制度的執行力。要通過制度的執行，把黨的思想建設、組織建設、作風建設和反腐倡廉建設落到實處。
第三，運用科學的方法是提高黨建整體效果的重要手段。加強新形勢下黨的建設的根本方法是統籌兼顧。一方面，黨的建設與經濟社會建設需要統籌兼顧。黨內民主與社會民主、黨內和諧與社會和諧、城市黨建與農村黨建等方面的關係是相互聯繫和相互促進的。用統籌的方法推進黨的建設和經濟社會建設，可以促進黨建新的偉大工程與黨的偉大事業的協同發展；另一方面，黨的自身建設也需要統籌。黨的階級性和人民性、黨內民主與黨內集中、黨員的權利與黨員義務、黨的領導與黨的執政、黨內的思想建設與制度建設、黨內教育與黨內懲處等方面的關係也是矛盾關係。運用統籌的方法處理黨內的矛盾關係，必然會提升黨的建設的整體效果。
三、緊緊抓住黨的建設的著力點，確保黨的政治目標的實現和執政基礎的鞏固
落實黨的建設的總部署是實現黨建總目標的重要步驟，而實施黨建總部署則需要抓住黨的建設的重點。xx屆四中全會《決定》指出：“全面貫徹黨的xx大關於黨的建設的總體部署，按照黨章的要求，著眼於繼續解放思想、堅持改革開放、推動科學發展、促進社會和諧，著眼於提高黨的執政能力、保持和發展黨的先進性，著眼於增強全黨為黨和人民事業不懈奮鬥的使命感和責任感，著眼於保持黨同人民民眾的密切聯繫。”四個“著眼於”是新形勢下加強黨的建設的新重點，也是推進黨建新的偉大工程更具體的前進方向。
第一，黨的建設要關注目的性。黨的建設是為政治路線服務的。xx屆四中全會《決定》指出：“堅持把推進黨的建設偉大工程同推進黨領導的偉大事業緊密結合起來。”當前，黨的建設要聚焦到中國特色社會主義的旗幟下，致力於全面落實科學發展觀，推動和諧社會建設。
第二，黨的建設要增強有效性。黨的執政能力建設和黨的先進性建設，是新形勢下加強黨的建設的主線。實踐證明，黨的先進性是靠執政能力支撐的。黨的執政能力有多強，黨的先進性水平也就有多高。沒有執政能力支撐的先進性往往是一個符號。xx屆四中全會強調執政能力建設和黨的先進性建設，彰顯了黨的建設的有效性，定位是推動社會的全面進步。
第三，黨的建設要贏得合法性。合法性是指人民民眾對執政黨的認同。加強黨的建設，要通過自身形象的塑造，贏得人民的高度信賴和認同。執政黨的最大危險是脫離民眾，最大的優勢是聯繫民眾。因此，加強黨的建設，要始終把贏得合法性作為一個基礎工程。