5.1碼頭管理中心組織全體員工不分班次，嚴格遵守紀律，服從組長指揮，加強巡視碼頭四周，檢查碼頭上的設備、物資緊固情況，確保完成全部物質、設備緊固工作，如發生意外，立即進行搶修或搶救並報告應急機構。
5.2檢查碼頭電器設備，若有必要可將岸電關閉。
5.3檢查關閉所有值班室門窗。
5.4保所有的應急燈和通訊正常。
5.5息所有動力機械，檢查值班房的楔快等。
5.6本階段為碼頭防颱風、風暴潮的關鍵階段，必須在防颱風、風暴潮的八級風前沿到達碼頭前的物資白天完成，在此期間要求每1小時向事業部應急指揮中心辦公室報告一次情況。
5.7碼頭所有人員到緊急集合點集合，聽從上級命令隨時準備撤離。
5.8當聯繫中斷，碼頭所在區域氣象情況快速惡化，要求值班車到位，碼頭所有人員在緊急集合點集合，碼頭應急領導小組根據具體情況有權依據自己的處境，做出提前撤離人員的決定。如果碼頭中心領導不能趕赴現場，碼頭現場調度和安全員履行碼頭中心主任職責。
6．當颱風、風暴潮中心通過碼頭所在區域（距離）後，或颱風、風暴潮警報解除後，碼頭進入防颱風、風暴潮第四階段（解除警報）。
6.1警報解除後，人員應迅速返回碼頭現場，並應進行仔細檢查。
6.2各種設備、器材固定及損壞情況；
6.3值班房及其底座；
6.4設備及電纜；
6.5碼頭基礎設施損壞情況:；
6.6碼頭破損情況；
6.7通訊設備損壞情況；
6.8碼頭應將檢查情況及對後勤保障的要求，報告事業部值班室，以利於恢復正常作業，同時，應將防熱帶氣鏇措施情況進行總結，上報事業部。事業部應將情況匯總後上報公司應急指揮中心辦公室。