自治區氣象局：負責天氣氣候監測和預測預報工作。對天氣形勢作出監測、分析和預測，在汛期及時對重要天氣形勢和災害性天氣作出滾動預報，並向自治區防指及有關成員單位提供天氣監測和預報信息。
自治區通信管理局：負責做好汛期公用通信網防汛通信保障工作，督促、檢查、協調區內電信運營企業做好公共通信設施的防洪建設和維護。
廣西海事局：加強通航秩序和通航環境管理，負責管轄區範圍內的禁航區、航道（路）、交通管制區、航外錨地和安全作業區等水域的劃定和監督管理，維護水上交通秩序，發布航行警（通）告；負責航海保障工作，管理管轄範圍內無線電導航和水上安全通信，組織、協調和指導所轄範圍內的水上搜尋救助。
廣西軍區：負責組織指揮所屬部隊、民兵和預備役部隊，協調駐桂友鄰部隊，執行抗洪搶險、營救民眾、轉移物資的急、難、險、重任務。
武警廣西總隊：負責組織武警部隊實施抗洪搶險，參加重要工程和重大險情的搶險工作。協助公安部門維護搶險救災秩序和災區社會治安，協助當地人民政府轉移危險地區的民眾。
空軍南寧指揮所：負責空軍部隊參與抗洪搶險救災的組織、協調和指揮工作。
廣西電網公司：做好所轄供電區域受災地區供電工作，優先安排防汛搶險緊急用電，負責本系統水電工程防洪安全調度工作。
柳州鐵路局：負責所轄鐵路運輸的防洪安全，確保行車安全和運輸暢通。組織實施鐵路防洪工程和設施的建設與維護，負責本系統防洪安全調度工作。組織運送防汛搶險和衛生防疫人員、物資及設備。
廣西紅十字會：參與災區救災和傷員救治工作，參與國內外救災捐贈款物的接收、發放和管理。
2.1.4 自治區防辦職責
貫徹執行國家有關政策法規和國家防總的決定、調度命令以及自治區黨委、自治區人民政府的指示；負責自治區防指日常工作，督促檢查防汛措施的落實；組織制訂區內主要江河防洪預案、重要水利工程洪水調度方案，並監督實施；組織協調各級人民政府、各有關部門實施防汛責任制，參
與組織抗洪搶險工作並進行業務技術指導；負責防汛通訊及調度現代化的規劃、建設和管理；會同有關部門做好防汛物資計畫儲備和使用管理工作，提出防汛經費的分配使用計畫並監督實施；及時準確掌握汛情、災情和水利工程的運行狀況，必要時發布雨水情信息、水情預報和汛情公報；提出全區防汛部署和決策建議，供自治區人民政府和自治區防指決策；會同有關部門調查處理防汛重大事故。
2.2 市、縣兩級人民政府防汛指揮機構
有防汛任務的市、縣兩級人民政府設立防汛指揮機構，在上級防汛指揮機構和本級人民政府的領導下，組織和指揮本地區的防汛工作。市、縣級防汛指揮機構由本級人民政府及其有關部門、當地駐軍、人民武裝部負責人等組成，其辦事機構設在同級水行政主管部門。
2.3 其他防汛指揮機構
在汛期，水利部門所屬的水利工程管理單位、施工單位以及水文部門等，要成立相應的專業防汛抗災組織，負責本單位的防汛抗災工作；有防汛任務的重大水利水電工程、大中型企業根據需要成立防汛工作機構。針對重大突發事件，可以組建臨時指揮機構，具體負責應急處理工作。