新生兒科：對新生兒窒息及呼吸衰竭的患兒進一步提高呼吸機使用管理水平；進一步提高治療早產兒的成活率。
乳腺科：開乳腺病病房，與上級醫院建立協作夥伴關係，在上級醫院專家的指導下，逐步開展乳腺癌的根治術，同期開展化療並建檔統計治療率及存活率。
產科：開展無痛分娩及一對一的全程陪伴式服務；建立妊高症臨床實驗室，派出部分醫務人員外出學習臍血流分析及產科急救知識，通過臨床對妊高症臍血流波形的檢測，來了解胎盤循環與圍生兒愈後的關係，降低圍生兒的窒息率和死亡率。
婦科：規範惡性腫瘤的治療，並統計各類惡性腫瘤的治癒率及存活率。
宮頸疾病門診：開展宮頸各類疾病的診斷和治療，並建檔統計各類治癒率，逐步開展宮頸電切術。
兒內科：逐步完成兒內科重點專科病房建設，按專業分組收治病人。每專業組均由專科負責人負責；與上級醫院建立協作關係(首都兒研所)，在專家的指導下完成兒內科重點專科建設及開展相關的科研活動，提高兒內科的醫療診療水平及知名度。
兒科胃腸腔鏡科：開展小兒胃炎及腹痛與幽門螺鏇體相關感染的診斷及兒童腸鏡的檢查項目。
兒保科：開設兒童心理門診，由主治職稱以上醫師定期坐診，擴大保健業務層面；開展新生兒篩查工作(苯丙酮尿症、甲低、、聽力篩查)；設立0～3歲早期兒童教育室，將0～3歲早期教育更深入細緻地開展，並開展“0～3歲早期教育＂門診，將我院出生的新生兒，尤其是高危兒系統地管理起來；規範兒童康復的診療、操作、管理工作，引進康復專業本科畢業生以加強康復科的力量；開設青春期門診、矮身材門診等保健特色門診。
群保科：進一步加強對基層婦幼保健院(站、所)的專業技術人員的培訓工作；繼續做好六位一體的社區衛生服務工作；開展新生兒20項行為神經測定、嬰幼兒智慧型發育、九江市男性與生殖健康狀況服務和衛生保健服務模式研究等科研工作。
對重點專科取得兩個效益顯著者醫院給予一定獎勵。
(二)以加強醫療質量為核心，以控制病例單元質量為重點，以終未質量信息反饋為導向，繼續推行全程醫療質量管理。按照婦幼保健院質量管理要求，建立三級考核制度。即科室－醫務科－醫院。醫務科將業務指標及醫療質量指標下達到各科室。各科室成立考核小組，科主任為組長，每月考核一次。要求各科室每月底將考核結果上報醫務科，醫務科每月完成全院28個單元考核及時上報醫院行管科。對無故不及時完成考核科室或考核不到位的科室，扣發科主任當月津貼。
(三)實行三級醫生業務考核及查房考核制度。對住院醫生、主治醫生分年資由科主任、醫務科分別進行考核，並建立技術業務考核本。對三級醫師每季進行1～2次三級查房考核，並將結果通報全院。
(四)醫務科組織院學術委員會或請專家對重點專科每季進行一次檢查、督促，並將結果及時匯報院領導，以便及時調整專科的發展。
(五)聘請省內外專家來院手術示範及教學查房，以提升我院的技術水平。婦產科以不孕症、產科併發症，腔鏡手術、婦科腫瘤進行專科指導。年內爭取請兒科專家來我院進行專科指導，並向培養科室提出培養目標。到期未達標者，科主任向全院匯報原因。