（三）外商投資企業所得稅
①檢查各項應稅收入（收益）的真實性、完整性。
一是生產經營收入部分，是否有應計未計產品銷售（經營）收入、視同銷售是否計入收入。二是財產轉讓收入、租賃收入、利息收入、特許權使用費、股息收入等是否存在少計收入的情況；國庫券利息收入是否多計收入。三是其他收入（包括固定資產盤盈收入、罰款收入、因債權人緣故確實無法支付且兩年以上的應付款項、物資／現金的溢余收入、應稅的補貼收入、逾期包裝物押金、保險無賠款優待、手續費收入等）是否存在少計收入的情況。四是接受捐贈收入是否計入當年應稅所得額。五是非貨幣資產投資收益、對外投資的股權收益及其成本費用的核算是否屬實。
②檢查稅前扣除項目的真實性、合法性、合理性。
第一、是否多列支製造費用、生產成本、產品銷售成本，有無多計其他業務成本。
第二、核實下列各項費用的列支是否超過法定比例或標準；跨行業經營的，是否按適用比例分別計算列支限額：交際應酬費、工資福利費、工會經費、職工教育經費、借款利息費用等。
第三、核實須經稅務機關審批後列支的項目（如財產損失、壞帳準備金及其它減值準備）：一是有無未經稅務機關批准而擅自列支的問題。二是計提金額是否超過規定的列支比例。三是有無應在免稅期或減半期列支的損失而在減半期或全額徵稅期列支從而人為調節應納所得稅額的問題。四是實際發生壞帳損失時是否沖減壞帳準備；對於超過上一年度計提的壞帳準備部分，是否作為當期損失列支；少於上一年度計提的壞帳準備部分，是否計入本年度應納稅所得額；已經作為壞帳損失在所得稅稅前扣除的應收賬款，在以後年度收回時是否計入當期應納稅所得額。五是存貨跌價減值準備、短期投資跌價減值準備、長期投資減值準備、固定資產減值準備、無形資產減值準備、在建工程減值準備、委託貸款減值準備等七項預提準備金是否已經進行納稅調整。
第四、重點檢查項目。一是銷售提成，有無重複列支供銷人員的工資、獎金、差旅費和交際應酬費問題；是否沖減銷售收入；是否以“白條”列支。二是技術開發費，是否有技術開發計畫和費用預算方案，是否提供政策資料；當年發生的技術開發費是否超過上年實際發生額的10％；有無超範圍歸集技術開發費套取加成扣除的情況；有無把以前年度未扣除完或不允許扣除的開發費在本年度扣除。三是用於中國境內的對外捐贈，是否屬於公益救濟性捐贈；是否直接支付給受贈人；有無將攤派支出、贊助支出等作為對外捐贈列支的問題。四是預提費用，是否按照權責發生制提取和列支；除水電費等允許預提的項目外，是否還預提其它費用並稅前列支。五是支付給有關部門的管理費，企業支付管理費的主管部門是否為其提供了相關服務；企業支付給主管部門的管理費，是否有規定的收費標準，或者是否符合市場同類服務的收費標準；支付給關聯企業的管理費不得列支。六是職工培訓費，企業開業前發生的職工培訓費，是否未計入企業的開辦費；企業為培訓職工而購建的固定資產、無形資產等支出，是否直接作為職工培訓費進行列支。七是其他項目，如土地（場地）使用費、租金支出、董事會或董事費等。