《晉書》卷十 帝紀第十

五年春二月丙子，孫恩復寇浹口。呂超殺呂纂，以其兄隆僣即偽位。三月甲寅，眾星西流，歷太微。夏五月，孫恩寇吳國，內史袁山松死之。沮渠蒙遜殺段業，自號大都督、北涼州牧。六月甲戌，孫恩至丹徒。乙亥，內外戒嚴，百官入居於省。冠軍將軍高素、右衛將軍張崇之守石頭，輔國將軍劉襲柵斷淮口，丹陽尹司馬恢之戍南岸，冠軍將軍桓謙、輔國將軍司馬允之、游擊將軍毛邃備白石，左衛將軍王嘏、領軍將軍孔安國屯中皇堂。征豫州刺史、譙王尚之衛京師。寧朔將軍高雅之擊孫恩於廣陵之郁洲，為賊所執。秋七月，段璣殺慕容盛，盛叔父熙盡誅段氏，因僣稱尊號。九月，呂隆降於姚興。冬十月，姚興帥侵魏，大敗而鏇。是歲，飢，禁酒。

元興元年春正月庚午朔，大赦，改元。以後將軍元顯為驃騎大將軍、征討大都督，鎮北將軍劉牢之為元顯前鋒，前將軍、譙王尚之為後部，以討桓玄。二月丙午，帝戎服餞元顯於西池。丁巳，遣兼侍中、齊王柔之以騶虞幡宣告荊、江二州。丁卯，桓玄敗王師於姑孰，譙王尚之、齊王柔之並死之。以右將軍吳隱之為都督交廣二州諸軍事、廣州刺史。三月己巳，劉牢之叛降於桓玄。辛未，王師敗績於新亭，驃騎大將軍、會稽王世子元顯，東海王彥璋，冠軍將軍毛泰，游擊將軍毛邃並遇害。壬申，桓玄自為侍中、丞相、錄尚書事，以桓謙為尚書僕射，遷太傅、會稽王道子於安城。玄俄又自稱太尉、揚州牧，總百揆，以琅邪王德文為太宰。臨海太守辛景擊孫恩，斬之。是月，禿髮利鹿孤死，弟辱檀嗣偽位。秋七月乙亥，新蔡王崇為其奴所害。八月庚子，尚書下舍災。冬十月，冀州刺史劉軌叛奔於慕容德。十二月庚申，會稽王道子為桓玄所害。曲赦廣陵、彭城大逆以下。

二年春二月辛丑，建威將軍劉裕破徐道覆於東陽。乙卯，桓玄自稱大將軍。丁巳，冀州刺史孫無終為桓玄所害。夏四月癸巳朔，日有蝕之。秋八月，玄又自號相國、楚王。九月，南陽太守庾仄起義兵，為玄所敗。冬十一月壬午，玄遷帝於永安宮。癸未，移太廟神主於琅邪國。十二月壬辰，玄篡位，以帝為平固王。辛亥，帝蒙塵於尋陽。

三年春二月，帝在尋陽。庚寅夜，濤水入石頭，漂殺人戶。乙卯，建武將軍劉裕帥沛國劉毅、東海何無忌等舉義兵。丙辰，斬桓玄所署徐州刺史桓修於京口，青州刺史桓弘於廣陵。丁巳，義師濟江。三月戊午，劉裕斬玄將吳甫之於江乘，斬皇甫敷於羅落。己未，玄眾潰而逃。庚申，劉裕置留台，具百官。壬戌，桓玄司徒王謐推劉裕行鎮軍將軍、徐州刺史、都督揚徐兗豫青冀幽并八州諸軍事、假節。劉裕以謐領揚州刺史、錄尚書事。辛酉，劉裕誅尚書左僕射王愉、愉子荊州刺史綏、司州刺史溫詳。辛未，桓玄逼帝西上。丙戌，密詔以幽逼於玄，萬機虛曠，令武陵王遵依舊典，承制總百官行事，加侍中，余如故。並大赦謀反大逆己下，惟桓玄一祖之後不宥。夏四月己丑，大將軍、武陵王遵稱制，總萬機。庚寅，帝至江陵。庚戌，輔國將軍何無忌、振武將軍劉道規及桓玄將庾稚、何澹之戰於湓口，大破之。玄復逼帝東下。五月癸酉，冠軍將軍劉毅及桓玄戰於崢嶸洲，又破之。己卯，帝復幸江陵。辛巳，荊州別駕王康產、南郡太守王騰之奉帝居於南郡。壬午，督護馮遷斬桓玄於貊盤洲。乘興反正於江陵。甲申，詔曰："奸凶篡逆，自古有之。朕不能式遏杜漸，以致播越。賴鎮軍將軍裕英略奮發，忠勇絕世，冠軍將軍毅等誠心宿著，協助同嘉謀。義聲既振，士庶效節，社稷載安，四海齊慶。其大赦，凡諸畏逼事屈逆命者，一無所問。"戊寅，奉神主人於太廟。閏月己丑，桓玄故將揚武將軍桓振陷江陵，劉毅、何無忌退守尋陽，帝復蒙塵於賊營。六月，益州刺史毛璩討偽梁州刺史桓希，斬之。秋七月戊申，永安皇后何氏崩。八月癸酉，祔葬穆帝章皇后於永平陵。九月，前給事中刁騁、秘書丞王邁之謀反，伏誅。冬十月，盧循寇廣州，刺史吳隱之為循所敗。執始興相阮腆之而還。慕容德死，兄子超嗣偽位。