管轄權的轉移和移送管轄雖然都是將行政案件由一個人民法院轉給另一個人民法院，但二者有實質的區別：
（1）管轄權的轉移是有管轄權的人民法院將行政案件的管轄權轉移給本無管轄權的法院，其轉移的是行政案件的管轄權；而移送管轄則是無管轄權的人民法院把不屬於自己管轄但已受理的行政案件移送給有管轄權的人民法院，其移送的不是管轄權也不可能是管轄權，法律教育網而只是行政案件。法律教育網
（2）管轄權的轉移只能在上下級人民法院之間進行；移送管轄一般是在同級異地人民法院之間進行，也可以在上下級人民法院之間進行。
（3）管轄權轉移應經上級人民法院決定或同意，否則不得轉移。下級人民法院只能提出管轄權轉移的建議；移送管轄則不需要經過其他人民法院的決定或同意。