根據《衛生部、人事部關於下發〈具有醫學專業技術職務任職資格人員認定醫師資格及執業註冊辦法〉的通知》（衛醫發[1999]第319號）檔案、江西省衛生廳《關於做好具備醫學專業技術職務任職資格人員醫師資格認定工作的通知》（贛衛人發[1999]第167號）檔案，從1999年底開始，我省對全省近6萬名具有醫師或醫士職 稱的人員進行了醫師和助理醫師資格認定，2000年4月，接《衛生部關於進一步做好醫師資格認定工作的通知》（衛人發 [2000]第117號）檔案，檔案中第十條規定了醫師資格證編碼由23（26）位數字組成（詳見附屬檔案），我省按照此檔案執行醫師資格證編碼，並於 2000年底頒發了醫師資格證書。2000年12月14日，衛生部、國家中醫藥管理局下發了《關於做好醫師資格證書及醫師執業證書發放工作的通知》（衛醫發[2000]447號）檔案，檔案又制定了新的《醫師資格證書編碼規定》，醫師資格證書編碼由24（27）位數字組成（詳見附屬檔案），但此時我省近6萬份證書巳經下發，經請示衛生部人事司，答覆是江西編碼沒有錯，兩種編碼都可以全國通用。北京市、黑龍江省的醫師資格證編碼與我省一樣，也是按（衛人發 [2000]第117號）檔案規定編碼。全國其他各省均可註冊，唯獨廣東省不予以註冊。鑒於這種情況，我們曾多次向衛生部人事司反映，希望衛生部能夠從中協調，也給廣東省衛生廳去函希望能夠給予我省衛生專業技術人員的方便。在多次協調未果的情況下，決定對去廣東省打工的江西執業醫師，凡本人要求，經核實準確，允許更換執業醫師資格證書，隨來隨辦。至今巳為我省到廣東省打工人員更換了執業醫師資格證書1897份。
江西省第一批認定的執業醫師資格人員，於2001年上報了衛生部，於2004年7月在江西衛生人才人事網上公布，只要登入“江西衛生人才人事網（），”輸入姓名和身份證號碼，便可查詢到。並在查詢網面的首頁對編碼問題作了說明。