財政部《關於耕地占用稅具體政策的規定》（〔87〕財農字第206號）中明確規定：對未經批准已占用的耕地，1987年4月1日以後到土地管理部門辦理用地手續的，應照章徵收耕地占用稅。
具體執行中的政策界限是：對未經批准已占用的耕地，凡按照土地管理政策規定1987年4月1日後需補辦用地手續的，一律照章徵收耕地占用稅，追繳稅款的期限以當地土地管理部門規定需要補辦用地手續的占地追溯期限為準。土地管理部門未成立前，經政府其他部門批准已占用的耕地，1987年4月1日以後按規定到土地管理部門辦理換證手續的，免徵耕地占用稅。