日前，世界上最具權威的學術信息機構美國thomsonisi學術信息會社，公布了由研究機構發表的論文被其他研究者所引用的次數排行榜。按各區域來分，東京大學和東北大學分別在物理學和材料科學方面排名世界第一，而中國的清華大學僅在材料科學方面排第64名。在自然科學與社會科學的綜合排名中，東京大學居世界第16位，位居日本國內第一，而中國的大學則沒有一所進入前100名排行榜。
據美國thomsonisi學術信息會社日本事務所介紹，這次的研究機構論文被引用排行榜，與以前的各研究機構論文發表排行榜有著質與量的區別。過去大家比較重視在世界上最具權威的雜誌等學術刊物上所發表的論文數量，並以此來進行排榜，量的概念起了主導作用。而此次thomsonisi學術信息會社對各研究機構發表的論文被引用的數據進行統計，試圖從質的角度來對各研究機構進行一次排行，而被統計的論文是從1992年起至2002年的11年間發表的論文。
在綜合排行榜中，世界上共有3291個研究機構進入了排行，其中日本有5所大學進入了前100位，它們是東京大學第16名、京都大學第30名、大阪大學第36名、東北大學第82名、名古屋大學第99名，而私立的慶應大學排名第332位，位居日本國內第14位。
在化學方面排行中，共有716個研究機構進入排行，其中東京大學排名世界第2，京都大學排名第3，東京工業大學第10、大阪大學第16、東北大學第17位，共有5所大學進入了世界前20名排行。中國的南京大學排名世界第237名，位居中國國內第一。
在物理學方面排行中，共有563個研究機構，東京大學位居世界首位，被引用數高達12萬6041。東北大學排名第17名，大阪大學排名第29名，京都大學排第30名，東京工業大學排名第58名，日本只有10個研究機構進入了前100名排行榜。中國的南京大學排名世界第269名，位居中國國內第一。
在材料科學方面排行中，共有487個研究機構，東北大學排名世界第1，京都大學第8，東京工業大學第12，大阪大學第15，東京大學第19。日本有5所大學進入前20名。中國的清華大學排名世界第64位，位居中國國內第一，並且是惟一一所進入前100名排行榜的大學。”
看完以上對比，本來我還不以為然，日本人不就會砸有錢么。可我又看到關於日本大學的科研經費的部分：
2003年 科研費ランキング大學別配分総額
位 大學 千円
1 東京大 14,675,200
2 京都大 8,012,770
3 大阪大 5,970,410
4 東北大 5,882,780
5 北海道大 4,043,580
“千円” 指 “千日元” 即 日本科研經費第一的東京大學 一年的經費也只有147億日元，折人民幣不過11億左右。 而我們中國的老大，清華大學2000年的科研經費即達到7億。即使從絕對數量上看也與東京大學差距不大。考慮到中日人工和物價的巨大差異（約8倍），似乎不能說日本大學更富有。沒有錢是萬萬不行的，但有了錢就一定能辦出世界一流大學嗎？ 中國大學僅僅只是缺錢嗎？還缺什麼？ 日本近年以來，在諾貝爾獎上屢獲突破，可以認為已經擺脫了過去重工輕理的科研傾向，從基礎研究的各個領域全面向世界一流發動衝擊。