水處理後的飲片，含水量較高，給微生物的生長繁殖提供了良好條件。如果不及時乾燥，則飲片宜於變色，甚至發霉變質，影響療效。飲片的乾燥方法較多，一般分為自然乾燥和人工乾燥兩大類。
自然乾燥
自然乾燥是指把切制好的飲片置於日光下曬乾或於陰涼通風處晾乾。
1．曬乾法 一般飲片的乾燥均可套用“曬乾法”，將飲片平攤在蓆子、竹匾或潔淨的水泥地面上，不時翻動至乾燥即可。［注意］
2．陰乾法 含芳香揮發性成分類藥物宜用“陰乾法”，即將飲片薄攤於空氣流通的陰涼場所，使水分緩緩蒸發，直至乾燥。對於一些色澤鮮艷、日照易變色或走味的藥材如紅花、黃連、檳榔、黃柏、降香等，可置於通風處自然風吹至乾。
3． 不同種類藥物的乾燥方法如下： 種 類 成 分乾 燥 方 法藥 物 舉 例粘性類藥物 粘多糖等明火烘焙天冬、玉竹、地黃等 芳香類藥物 揮髮油等陰乾或輕曬乾荊芥、薄荷、藿香等 粉質類藥物 澱粉類等隨切隨乾，覆物輕曬山藥、浙貝等 油質類藥物 油脂或揮髮油日曬，不宜烘焙當歸、川芎、懷牛膝等 色澤類藥物色素類成分白色類宜曬乾
黃色類宜小火烘乾 桔梗、浙貝等
澤瀉、黃
人工乾燥
人工乾燥是利用一定的乾燥設備，烘乾藥物的方法。傳統用火炕、烘藥籠等；現代用烘箱、乾燥室、乾燥機等。人工乾燥的優點是不受季節氣候的影響，可以隨時進行乾燥，且比自然乾燥衛生清潔，並能縮短乾燥時間，提高幹燥效率。但是需要一定的機械設備和耗費能源。
人工乾燥的溫度應有所控制，一般藥物≯80℃；芳香性藥物、含油質類藥物≯50℃。乾燥後飲片的含水量一般應控制在7%～13%之間。
乾燥後的飲片宜放冷後收貯，否則餘熱使飲片吸濕回潮，貯藏時易發生霉變。