出納工作的基本原則主要指內部牽制原則或者說錢賬分管原則。《會計法》第二十一條第二、三款規定：“會計機構內部應當建立稽核制度。出納人員不得兼管稽核、會計檔案保管和收入、費用、債權債務賬目的登記工作。”錢賬分管原則是指凡是涉及款項和財物收付、結算及登記的任何一項工作，必須由兩人或兩人以上分工辦理，以起到相互制約作用。例如，現金和銀行存款的支付，應由會計主管人員或其授權的代理人審核、批准，出納人員付款，記賬人員記賬；發放工資，應由工資核算人員編制工資單，出納人員向銀行提取現金和分發工資，記賬人員記賬。實行錢賬分管，主要是為了加強會計人員相互制約、相互監督、相互核對，提高會計核算質量，防止工作誤差和營私舞弊等行為。
《會計法》專門規定出納員不得兼管稽核、會計檔案保管和收入、費用、債權債務賬目的登記工作，是由於出納員是各單位專門從事貨幣資金收付業務的會計人員，根據複式記賬原則，每發生一筆貨幣資金收付業務，必然引起收入、費用或債權、債務等賬簿記錄的變化，或者說每發生一筆貨幣資金收付業務都要登記收入、費用或債權、債務等有關賬簿，如果把這些賬簿登記工作都由出納員辦理，會給貪污舞弊行為以可乘之機。同樣道理，如果稽核、內部檔案保管工作也由出納員經管，也難以防止利用抽換單據、塗改記錄等手段進行舞弊的行為。當然，出納員不是完全不能記賬，只要所記的賬不是收入、費用、債權、債務方面的賬目，是可以承擔一部分記賬工作的。總之，錢賬分管原則是出納工作的一項重原則，各單位都應建立健全這一制度，防止營私舞弊行為的發生，維護國家和單位財產的安全。