據報導，使用7天的菜板表面每平方厘米病菌多達20萬個，對人們的健康是一個很大的威脅，因而使用菜板要經常消毒。
常用的消毒方法有以下幾種：
洗燙消毒：先用硬刷和清水將菜板表面和縫隙洗刷乾淨，然後再用100℃的開水沖洗一遍。
陽光消毒：陽光中的紫外線有殺死細菌的作用，菜板不用時應放到太陽底下曝曬，這樣不僅可以殺死細菌，而且可使菜板乾燥，減少病菌繁殖。
撒鹽消毒：每次使用菜板後，都要用刀將板面的殘渣刮淨，每隔6～7天在板面上撒一層鹽，這樣既可殺菌，又可防止菜板乾裂。
蔥姜消毒：菜板用久了，會產生怪味。用生蔥或生薑將案板擦遍，然後一邊用熱水沖，一邊用刷子刷洗，怪味就會消失。
醋消毒：切過魚的菜板，只要灑上點醋，放在陽光下曬乾，然後用清水沖刷，就不會有腥味。