儘管我們具有較好的發展機遇和較多的有利條件，儘管我市水文事業得到了快速發展，但是按照水利部的治水新思路和市水利局提出的九大建設和發展任務及全國水文會議提出的全面加強水資源監測與分析的高要求，重慶水文任重而道遠。我們還存在很多突出的問題，主要表現在：一是水文站網結構仍不合理。站網是水文的基礎，目前我市水文站網分布狀況是東部多，西部少，省界斷面和大中型水利工程水庫斷面上的水文站點稀少，不能滿足為水利工程服務的需求。首先要抓科學的規劃管理，我關注的是市局直接管理的5000km2以上的流域，區縣級管理的1000km２的流域，如何合理的布置好網站、改造好網站，合併一些、建設一些，改造一些，對三峽庫區形成後次級河流上游段的管理，庫區、庫尾河段的開發利用做到心中有數，組成一個完整的、合理的重慶水文站網。二是水文監測能力不足。其測報手段落後，監測成果和服務水平還滿足不了我市水利建設和經濟社會可持續發展對水文的高需求。要通過防汛調度這塊，把局裡指揮系統搞起來；通過信息系統這塊，大家互相合作，把局域區域網路和局域外網建立起來，逐級向縣級發展，按我的目標是要達到整個水情信息調度在局辦公樓就辦到了，那才叫水文現代化。三是業務技術力量薄弱，科研成果較少。職工隊伍高素質人才匱乏，業務技術骨幹青黃不接，管理水平還不高，不能適應水文事業跨越式發展的需要。四是水文基層職工生產、生活條件仍然艱苦，存在很多困難。
產生這些問題的主要原因：
一是投入機制尚未理順
近兩年來，市水文局投入了基建資金和各種專項資金XX余萬元，辦了一些實事，解決了一些問題。但由於水文沒有穩定的預算內投資，現在國家水利投資政策重點是保續建、保掃尾，這從客觀上為我們爭取更多的國家投入帶來了很大的壓力，要完成水文"十五"計畫的投入，僅靠市基建統籌資金和部水文局的一點補助是遠遠不夠的。投資的不足是制約我們水文發展的很重要的因素。
二是法規不健全
目前水文方面的法規僅有10多年前頒布的老《水法》的配套法規《水文管理暫行辦法》和我市出台的《重慶市水文管理辦法》，新《水法》頒布後，按照新《水法》要求，需建立一個適應現代水文發展的水文立法制度，否則在職責上不能滿足新時期重慶經濟社會發展對水文工作的要求，缺少應有的法律地位，對加強水文行業管理也缺少約束力。水文行業是一個基礎性、公益性強的行業，沒有法規的保證，工作開展起來就有很大的難度。
三是思想認識沒有完全到位
目前我們還有部分水文幹部職工對水文自身的職能職責、地位、作用認識模糊，存在思路不清、積極性不高、責任不強等問題。要牢記，水利人和水文人這種獻身、求實、負責的精神不能丟，還要繼續發揚。
二、重慶水文要為我市水資源永續利用提供可靠的技術支撐
全國水文工作座談會明確了今後水文事業的發展方向，全市水利水電工作會議提出了我市未來五年水利建設和發展的九大指標，市水文局要緊緊圍繞新的發展方向和"九大指標"，以"為水資源永續利用提供可靠支撐"為主線，認真解讀"九大指標"對水文的高需求，抓住大好發展機遇，把重慶水文搞上去。其奮鬥目標，應該是到XX年基本實現現代化，到XX年全面實現水文現代化。也只有達到這樣的水平，才能為主管局實施"九大指標"提供全方位的水文技術服務。為此，市水文局要在市水利局的高度重視和有關部門的大力支持幫助下，在未來五年內扎紮實實地抓好幾個方面的工作：