哎呀呀!小燕子和小魚兒的家附近建起了化工廠，工廠里排出的黑煙和污水，不但污染了空氣，而且還污染了小河。
一天、兩天、三天......化工廠的排煙量和排水量越來越大，之後，小燕子和小魚兒再也見不到蔚藍的天空和清澈的小河了。
一天，小燕子和小魚兒碰面了。小燕子對小魚兒說：“這家化工廠排出的黑煙真是難聞，而且黑煙把蔚藍的天空遮擋住了。”小魚兒接著說：“是啊!這些污水臭哄哄的，現在，水裡的氧分都不夠了，而且再也看不到原來那清澈的小河了。”
他們決定想辦法解決這件事。小燕子不分晝夜地思索著。他查遍了動物科技大學的所有相關資料，又設計了99張圖紙，終於研製了一台機器，叫“環境污染淨化器”。只要這台機器一遇到污水、廢氣，它就會把污水淨化成自來水，把廢氣淨化成能源。
日子一天天過去了，化工廠排出的廢氣越來越多，小燕子的機器實在吃不消。後來，連下出的雨都是酸雨了。小燕子和小魚兒只好離開這座美麗的村莊，到別處去生活了。
當這家工廠的老闆發現開始下酸雨，小河裡到處都是垃圾時，他才意識到自己為了賺錢，而導致了環境污染的嚴重後果，但現在想挽回也來不及了......