四是應對特大自然災害有新做法。今年夏季，百年不遇的特大旱災襲擊了川渝大地，兩省市漁業生產遭到嚴重破壞。為儘量減少漁業生產損失，重慶市從加強抗旱救災工作組織、落實抗旱保漁措施和恢復漁業生產三個方面採取措施，開展救災工作。同時爭取落實了200萬元救災資金，專項用於補貼魚種補救。由於抗災救災措施得力，保住了大批親魚和魚種，在一定程度上降低了災害損失。
五是服務新農村建設有新舉措。四川省各級漁業部門抓住各級政府規劃社會主義新農村建設的重要機遇，努力把水產發展納入規劃中去。截至目前，全省以水產為支柱產業規劃建設並已開始啟動的新農村達到183個。重慶市開展了“千村推進、百村示範”建設，漁業主管部門積極參與，規劃漁業對接項目，並推動建設了兩個提高漁業綜合生產能力示範村。
兩地漁業的快速發展，為調整地方農業產業結構、建設現代農業，繁榮農村經濟、增加農民和三峽庫區移民收入，發揮了積極的作用。
三、主要問題與挑戰
今年以來，兩地漁業在遭受特大旱災的情況下，取得了較好的成績，但是也還存在一些問題和制約因素。當前最突出的問題是：
第一，特大旱災造成漁業生產巨大損失，且潛在不利的後續影響。
百年不遇的特大旱災給兩省市漁業生產帶來巨大損失。據統計，四川省漁業受災面積達162.03萬畝，損失水產品8.53萬噸，損失達6.4億元，分別占2005年水產品總產量和漁業總產值的8%、4%。重慶市損失更為嚴重。全市12萬畝池塘、500多座小型水庫乾涸、10萬畝河溝斷流。因災損失水產品47630噸，直接經濟損失共達6.3億元，占2005年水產品總產量和漁業總產值達19%、17%。
這次特大旱災不但造成了魚類大量死亡，間接損失也較為嚴重。為減少損失，漁民被迫將大量成魚提前出塘銷售，由於規格尚小，且集中銷售，導致售價極低，效益大幅下降，漁民入不敷出。此外，由於旱災導致大量養殖戶儲備的魚種死亡，對今後的恢復生產造成了不利影響。“水”和“種”將成為今後一段時期乃至明年制約漁業生產的兩個關鍵因素。
第二，三峽水庫蓄水後對漁業資源造成不利影響，漁業發展和漁民增收面臨困難。
三峽水庫蓄水後，隨著水位的升高，庫區水域生態環境也發生了顯著的變化，對庫區漁業發展帶來較大影響：一是主要經濟魚類產卵場發生重大變化，原有822處傳統魚類產卵場約85%消失；二是庫區水域魚類種群數量嚴重不足，組成結構明顯低質化；三是水位升高后，江水基本沒有流速，捕撈生產方式和網具發生變化，需用靜置高網捕撈，但是漁民缺乏資金更換網具，仍沿用原有的流刺網捕撈，捕撈效率極低。
上述影響導致庫區漁民的捕撈量大為減少，收入大幅度減少。據重慶市萬州區介紹，三峽蓄水前的2002年單船年捕撈量在1500公斤左右，漁民人均收入5000元以上，2005年單船捕撈量僅為579公斤，降低約三分之二，同時由於燃油等生產資料價格上漲，漁民人均收入約2000元，降低了約60%，比當地農民人均收入還要低300元左右。
第三，對三峽庫區漁業發展思路和措施認識尚未統一，庫區漁業發展尚未起步。
10月27日，三峽水庫蓄水水位達到156米，水面面積也由此大幅增加，達到140萬畝，未來蓄水到175米後水面將達到162萬畝。為充分發揮庫區水面資源優勢、發展庫區產業、增加庫區移民收入，有關部門在三峽水庫移民發展規劃中，確立了漁業、柑橘、草飼牲畜、旅遊作為庫區四大支柱產業。但是，由於有關方面對三峽水庫漁業發展的思路和措施存在不同看法，一些專家以保護庫區水質為由，反對在庫區進行任何形式的水產養殖生產，庫區漁業發展規劃至今沒有出台，導致庫區漁業發展缺乏指導，成為最有潛力但是發展最為滯後的產業。