改革開放以來，我國中小企業獲得了長足發展，在經濟生活中扮演著越來越重要的角色，成為支撐我國經濟發展的一支重要生力軍，在目前全國工商註冊登記的中小企業占全部註冊企業總數的99％，工業總產值和實現利稅分別占全國的60％和40％左右。近幾年來，在每年1500億美元左右的出口總額中，中小企業占到約60％。經濟決定稅收，只有這些企業發展壯大，才能大幅度提升稅收收入的總量規模，實現經濟與稅收的良性互動。地稅部門作為政府經濟調控的一個重要職能部門，如何用足稅法，服務企業，服務地方經濟，是擺在我們當前的重要課題。
一、中小型企業稅收管理的難點問題
相對於大型企業而言，現階段中小企業特別是鄉鎮企業、個體私營企業大多數還停留在手工記賬水平，在財務管理上存在的建賬不實、賬目不全、納稅申報不實的現象還比較普遍，導致稅收入庫難、查證難、執行難，偷逃稅現象亦難禁絕。由於中小企業點多面廣，經營變化大，稅源極為分散，開業停業頻繁，生產經營情況難以及時被稅務機關掌握，稅源監控的難度較大，稅收征管上還存在盲區。此外，部分國有集體企業採取拍賣、出售、整體轉讓等方式改制、改組為個體私營企業，納稅主體由單一主體變為混合主體，或由多個主體合併為一個主體，也給稅收征管增添了難度。
（一）、稅收核算不規範
一是賬目不健全。此類問題在中小商業企業中比較突出。部分企業不能按照稅務機關的要求設定、使用、保管賬簿。有的賬簿設定不全，有的設定賬外賬，甚至有的不設賬簿，造成收入、成本、費用憑證殘缺不全，會計信息失真，不能正確進行稅收核算。二是由於中小企業具有投資渠道廣、行業類型多、經營方式多等特點，核算涉及面較廣，尤其是委託代銷、還本銷售、以舊換新、折扣折讓等新型銷售方式的稅收核算涉及稅收政策比較多，與會計核算口徑有一定的差距，企業財務核算和稅收核算比較混亂，影響稅款計算的準確性。
（二）、欠稅現象較突出
一是由於企業經濟效益低，支付能力差，從而形成欠稅。從我縣情況看，企業生產的產品以勞動密集型為主，科技含量普遍不高，而且生產成本過高，導致產品缺乏市場競爭力，造成產成品大量積壓，占用資金較大，流動資金嚴重不足，難以保證稅款的及時足額入庫。二是部分國有集體企業採取拍賣、出售、整體轉讓等方式改制、改組為個體私營企業，為推進改制工作進程，各地出台了相關優惠政策，其中也包括有涉稅政策，使得有些稅款（如房屋等固定資產在轉讓、銷售環節的稅收）大多流失了，原企業的欠稅也因改制、改組而無法追繳入庫，形成“死欠”。三是稅務機關清欠力度不夠。一方面由於部分企業依法納稅意識不強，存在著“欠稅有利”、“欠稅有理”的錯誤認識；另一方面受執法環境的影響，稅收執法手段疲軟，這些都是導致清欠不力的因素。
（三）、異常申報率居高不下
在調查中發現，中小企業異常申報率占全年平均異常申報戶數的90％以上。這其中原因是多方面的。納稅人方面，一是納稅人受利益驅使，把自身利益同公共利益對立起來，總是千方百計的逃避納稅，通過隱匿收入等手段人為製造異常申報；二是納稅人會計核算水平差，業務素質低，對稅法的有關規定缺乏必要的了解，不能按照稅務機關的要求正確核算應納稅金，造成實際經營狀況同納稅申報不符。稅務機關方面，一是計算機套用相對滯後，不能很好的解決稅收征管與企業財務核算之間的矛盾；二是審核技術落後，只限於表面現象，缺乏深層次的挖掘；三是服務、輔導缺乏深度，對企業的經營狀況、發展需求缺乏深入的了解和指導。