事實證明，新農合政策不僅滿足了農民對醫療衛生服務需求的不斷增長，同時也緩解了農民看病難、看病貴的壓力。為提高人民的生活水平和全面建設小康社會，建設中國特色社會主義做出了很大的貢獻。
三、新農合運行中存在的問題
（一）農民沒有領會新農合的實質
在調研中我發現，部分鄉村幹部對參合農民的就醫與報帳程式、醫療費用補償辦法及普通門診和慢性病門診補助等政策了解不夠透徹，不少農民對如何辦理住院手續以及轉、轉院等程式均不了解，影響了參合農民的正常就醫和受惠程度。另外，由於宣傳不到位，農民民眾對以“大病救助、互助共濟、緩解因病致貧、因病返貧”為目標的新農合制度的精神實質了解不透，對新農合的補償期望過高。
（二）鄉鎮衛生院醫療技術水平有待提高
根據政策規定，鄉鎮衛生院作為農民第一級醫療保障機構，補償標準高於縣級及縣外醫療機構，但我們那裡唯一的一所鎮衛生院基礎設施差，醫療技術不高，服務水平跟不上，農民患病後，難以從鄉鎮衛生院得到有效的治療。而且，醫院沒有方便的生活輔助設施。叔叔去年在工地上摔傷了腿，我去醫院看望他的時候切身體會到了鎮衛生所醫療衛生服務差到了什麼程度：在衛生院住院沒飯吃、沒水喝，生活非常不方便。醫院房屋破爛、房屋採光不好，甚至有一部分病人在走廊上接受治療。雖然黨的政策好了，但惡劣的醫療環境和落後的醫療水平卻不能很好的滿足農民的醫療需求。
（三）工作難度大，經費不足
村幹部在農村合作醫療工作中有“三難”：宣傳動員難，籌集資金難，政策解釋難。新型農村合作醫療本著的是自願原則，但又要完成上級任務，各鄉鎮都把“新農合”工作納入對村級年度考核，村幹部普遍感到工作檯壓力大，嚴重影響他們開展工作的主動性和積極性。新農合參合人數多，工作量大，任務繁重。網路不通暢，給參合農民的報銷結算以及補償資金及時下撥造成很大的影響。
（四）對醫療機構的監管有待加強
新農合政策實施過程中，部分醫療機構出於經濟利益的考慮，想盡辦法使自身利益最大限度的實現，採取了一系列應對對策，一些醫療機構存在著不規範的醫療行為，影響到合作醫療資金的使用效果和效率。這也正是我下面要講的問題。
四、醫院騙保問題
案例4：
我的堂弟小明（化名）前年得了鼻炎，叔叔帶他到當地的一所專業治鼻炎的醫院(這是家私人辦的專治鼻炎的小型醫院)動了手術，共花費600餘元。由於當時還沒有合作醫療，所以那次並沒有報銷。2012年年初堂弟在縣學校辦理了合作醫療，叔叔嬸嬸在家也辦理了合作醫療。今年暑假堂弟鼻炎復發，根據前年醫院地承諾，若是復發，可以免費治療直至完全康復。於是他的家人就帶著他再一次奔赴那個醫院，希望醫生這次能治好堂弟的鼻炎。據堂弟說，這次的手術與上次的一模一樣，可是這次的手術醫藥費卻是2200餘元。到底是什麼原因導致了手術費的劇增呢？
原來就診之前嬸嬸就和醫院協商免費治療的事，可是醫院卻不大情願免費治療，這時，院長支了一招：用合作醫療報銷，報銷後剩下的錢呢，醫院方面“慷慨無私”的不要了，並且醫院願意報銷嬸嬸的路費。這樣做的好處多多：一是嬸嬸家相當於一分錢沒出，就給堂弟做了手術；二是醫院既沒有撕毀當初的協定，又達到了一分錢都沒少掙的目的，同時還顯得他們是那么無私。可謂一舉n得、一箭n雕啊！可是這時又出現了新的問題。弟弟的合作醫療是在縣裡的辦的，在鄉下不能用，怎么辦呢？這事可急壞了嬸嬸。就在事情難以解決的時候，醫院又給了一個“妙計”：弟弟治療全過程都用嬸嬸的名字頂替，等到縣裡報銷時別人要問起來就說是給嬸嬸看的病。這樣一來一切不就都妥了嗎？！這的確是個挺好的辦法，鄉下人哪管醫院的手段正當不正當，只要不花錢就行。於是叔叔到縣裡順利報銷了弟弟的手術費。