第十一條、第十條所列職工醫療保險基金收入項目按規定分別形成社會統籌醫療基金收入和個人帳戶醫療基金收入。
離休人員和老紅軍納入職工醫療保障制度改革範圍的，職工醫療保險基金收入項目應按規定分別形成離休人員和老紅軍醫療保險基金收入、社會統籌醫療基金收入和個人帳戶醫療基金收入。(一)社會統籌醫療基金收入是指按規定計入社會統籌的職工醫療保險基金收入。包括用人單位繳納的部分醫療保險費、上級補助收入、下級上解收入、社會統籌醫療基金利息收入、財政補貼、其他收入。(二)個人帳戶醫療基金收入是指按規定計入個人帳戶的職工醫療保險基金收入。包括用人單位按規定為職工繳納的一部分醫療保險費、職工個人繳納的醫療保險費、個人帳戶醫療基金的利息收入及轉移收入等。(三)離休人員和老紅軍醫療保險基金收入是指按離休人員和老紅軍前年平均實際支出醫療費用從職工醫療保險基金收入劃出，實行單獨管理，專項用於離休人員和老紅軍的醫療費支出的職工醫療保險基金收入。
第十二條、職工醫療保險基金收繳，使用省級財政部門統一印製的繳庫憑證。
第十三條、用人單位和職工個人繳納的醫療保險費由社會醫療保險事業機構根據核定的繳款數額，填寫繳庫憑證從用人單位開戶銀行按月繳至國庫內“醫療保險基金”專戶;所繳零星或小額款項可先繳至社會醫療保險事業機構在銀行開設的“醫療保險基金收入”戶，然後社會醫療保險事業機構再按月匯總繳至國庫內“醫療保險基金”專戶。小額款項的具體標準由地方財政部門規定。繳入國庫的醫療保險基金，應按規定轉入財政部門在指定銀行開設的“醫療保險基金專戶”。社會醫療保險事業機構的“醫療保險基金收入”戶除繳付國庫內“醫療保險基金”專戶外，原則上只收不支。
第十四條、社會醫療保險事業機構應按照政府核定的繳費率及時、足額收繳，不得擅自減免。
第四章基金支付
第十五條、職工醫療保險基金支出管理的原則是“以收定支，收支平衡，略有結餘”。
第十六條、職工醫療保險基金支出應執行國家規定的項目和標準，任何地區、部門、單位和個人不得以任何藉口擅自增加開支項目和提高標準。
第十七條、職工醫療保險基金支出項目包括社會統籌醫療費支出、個人帳戶醫療費支出、離休人員和老紅軍醫療費支出、利息支出、上繳上級支出、補助下級支出、轉移支出等。
社會統籌醫療費支出是指自付醫療費比例超過規定限額的職工個人，退休人員，按照規定報銷比例應由社會統籌醫療基金報銷的醫療費以及二等乙級以上革命傷殘軍人、患有國家認定特殊病種或實施計畫生育手術及其後遺症應由社會統籌醫療基金報銷的醫療費支出。
個人帳戶醫療費支出是指按規定應由個人帳戶支付的職工個人醫療費支出。離休人員和老紅軍醫療費支出是指離休人員和老紅軍按規定報銷的醫療費支出。利息支出是指發生臨時借款時的利息支出。上繳上級支出是指上繳上級社會醫療保險事業機構的職工醫療保險基金支出。補助下級支出是指撥付給下級社會醫療保險事業機構的職工醫療保險基金支出。轉移支出是指職工調離本地區，個人帳戶醫療基金隨同轉出等支出。