解決處理難。一是要加強案件處理協調工作，強化內部合作溝通，適應職務犯罪案件審查逮捕權上提一級的新形勢，主動商請公訴部門建立審查瀆職侵權犯罪案件的專門公訴人制度，加強辦案各環節相關人員的協作，形成工作合力。二是要強化外部協調，全程跟蹤案件處理直至審判，加強與法院的協調溝通，跟蹤法院的審判活動，對適用法律錯誤、量刑明顯不當的，要及時發現，提出建議，協助公訴部門依法抗訴。
解決阻力大。一是要主動接受黨委領導和自覺接受人大監督，使反瀆工作始終保持了正確政治方向的同時，爭取各方支持有效地排除阻力。二是按省檢院的要求充分發揮偵查一體化機制的實戰功能。下級院要主動爭取上級院的支持，市院要充分發揮自身優勢，加強對下指導、督導，切實擔負起為下級院排憂解難的責任，必要時，市級院可以採取交辦、提辦、參辦或異地指定管轄等措施排除干擾和阻力。
(四)不斷探索研究，建立和完善反瀆職侵權工作機制
一是要按省檢院的要求，根據辦案需要，逐步建立以檢察機關為主，相關司法、行政執法機關、專門行業技術管理部門和中介組織配合，各司其職、各負其責，依法查辦瀆職侵權犯罪的辦案模式。要按省檢院的要求，對重大複雜案件，檢察機關可以成立專案調查組，邀請公安、審計或相關行政執法部門作為成員單位共同參加調查。二是要按省檢院的要求建立由院領導牽頭，相關內設機構負責人參加的查辦瀆職侵權犯罪工作協作會議制度，整合內部資源，協調相關部門在查辦瀆職侵權犯罪工作中形成合力。要儘快與偵監、公訴、反貪、監所、民行、控告等部門建立案件線索移送機制。三是要按省檢院的要求探索和建立信息情報引導犯罪偵查機制。要設立專人或專門機構，具體負責瀆職侵權犯罪情報信息的收集、研判、管理工作;要把情報信息作為啟動偵查的源頭，把收集情報信息作為偵查的方式，把占有情報信息作為偵查決策的依據，形成情報信.息引導犯罪偵查制。四是要按省檢院的要求進一步健全和完善考評機制。要研究制定出以辦案規模為基礎、偵查效率、案件質量、辦案規範為要素的符合反瀆職侵權辦案工作特點的考核評價體系，推進反瀆職侵權工作走上辦案力度大、案件質量高、執法效果好的良性發展之路。
(五)高標準、嚴要求，不斷加強自身監督和機構隊伍建設
一是要認真貫徹落實陽光檢務的各項要求，在不違反國家和工作秘密相關規定的前提下，充分保障人民民眾的知情權、參與權和監督權，以公開求監督，以公開促公正。二是要認真執行訊問全程同步錄音錄像、各項備案、審批制度，嚴格執行逮捕職務犯罪嫌疑人上提一級的規定，正確處理與上下級偵查監督部門之間橫向縱向的監督配合關係，共同研究解決改革實施中出現的新情況新問題，防止自行其是、消極應付。三是要按照高檢院和省檢院確立的“穩定骨幹，充實力量，調整結構，保障辦案”的原則充實反瀆局的力量，切實解決個別區院反瀆職侵權幹警配備不足、人少質弱的問題，特別是要解決 “兩人局” 、“三人局”等突出問題，配強班子，配齊隊伍。要結合學習型反瀆局建設，開展好全員崗位大練兵、大比武活動，提高幹警的素質和能力，結合“恰守檢察職業道德、促進公正廉潔執法”主題教育活動和“反特權思想、反霸道作風”專項檢查，以更高的標準，更有力的措施抓好隊伍自身建設。