第一，在審計過程中應審查工程建設項目是否按規定的程式辦理各種開工前的審批手續和應交的規費，對手續不規範的建設項目要及時指出與糾正。第二，在審計過程中應審查工程建設項目是否嚴格按照《工程招投標法》的規定執行，是否進行了公開、公示和增加工程招投標的透明度，使各施工企業在公平、平等的前提下承攬工程，抑制建築市場中各種不正當的競爭手段，杜絕存在暗箱操作現象。第三，在審計過程中應嚴格審查投標、議標、中標的施工單位契約的簽訂是否正規、是否具備承攬工程的資質等級。杜絕不具備施工資質等級的（指掛靠的施工單位）單位進行投標。第四，在今後的審計工作中應進一步加大審計監督力度，對重點工程項目不論採取何種形式承包，竣工後都要進行審計，這是當今經濟社會發展的必然趨勢，在審計人員力量不足、專業性知識不全面的情況下，也要請社會審計力量對其進行有效的審計監督，要形成制度，逐步規範建築市場，給國家專項獎金和集體投資入的資金浪費降低到最低，進一步提高資金使用效率。第五，在審計過程中應嚴格審查建設單位專項資金的使用情況和立項的經濟效益如何，審查是否有擠占挪用、串項使用資金的現象發生，導致建設項目正常施工和運作。