引用什麼文章可以作為參考文獻，通常見諸於下列情況：①有助於說明本論文的研究背景的;②提供了技術或方法的;③作為重要數據來源的;④與表述自己的觀點有關的，無論是贊成還是反對，或部分同意部分有分歧，都值得把這篇文章引出供讀者分析、借鑑、判斷、評說;⑤對科研工作有啟示或幫助的。所以，引用參考文獻一定要遵守新穎、準確、完整、規範的基本原則。因此，撰寫醫學論文時引用參考文獻必須符合下述要求：
1.引用參考文獻儘可能是最新和最主要的關鍵文獻，除個別歷史文獻外，以最近3~5年以內的為好，少用舊的、次要的、年限長的或教科書中眾知公用的，忌用無關的文獻。引用年代較久的文獻，一般是經典的或作者就某個結論與之進行學術爭鳴和討論的文獻。將論文所涉及的歷史淵源、技術方法、引用數據以及與作者的研究密切相關而觀點相近或相反的論著列為參考文獻，可為讀者提供有關上述諸多內容的資料。
對於生物醫學文獻引用而言，普賴斯指數應在50%～70%。如果普賴斯指數高於70%，可說明本研究課題緊跟或代表了本學科當前的最高水平。普賴斯指數(price index)是用以評價被引用參考文獻時限性的重要指標，可用來評價醫學論文的發表價值，其定義是一篇論文中標註最近5年內公開發表的文獻數與該篇論文引用文獻的總數之百分比，用公式表達為：
普賴斯指數= ×100%
從公式可見，被引用的最近5年內文獻數越多，普賴斯指數就越高。實際上，它反映的是被引用文獻的老化程度。
2.引用參考文獻必須是已正式發表的，主要是引用正式發表的原著。未經發表或非公開發表的論文、譯文、文摘，或觀察資料、內部資料以及個人諮詢或通訊等均不可用作參考文獻，必須引用時，其作者、文題、刊名、出版年、卷次、期次、頁碼等可用圓括弧的形式插入正文內。尚未公開發表如屬某刊已通知作者將發表者，一般不可引用，特殊情況引用時可在刊名後用括弧註明“待發表”或“in press”。
3.引用的文獻必須是作者親自閱讀過的。不要轉引他人所用的文獻，即不能從綜述或其他論文的參考文獻中直接摘取，以免徒有數量而降低有針對性文獻的重要性。一般不能轉引二次文獻，對於未經查閱或未找到原文者，若非引用不可時應在該資料來源之前加“引自”二字，不能徑寫原文獻。親自閱讀對於該項研究有很明顯的啟發和幫助，切忌引用和著錄與此項研究論文不相關的參考文獻。
4.引用中醫經典著作時，則不列入參考文獻部分的著錄，而在正文所引句末或段落末加圓括弧註明出處即可。如：論文中引用的《靈樞·本藏篇》、《素問·陰陽應象大論》、《傷寒論·序》等。隨著中醫中藥的遺產的發掘及國際交流力度的加大，中醫中藥研究的論文也日趨劇增，作者在撰寫醫學論文時應正確引用和著錄中醫經典著作。
5.注意引用參考文獻一定要少而精，要刪掉可有可無、學術價值不高的參考文獻。目前國內一些醫學期刊對於參考文獻的引用數量都明確限制，論著引用不超過10條、綜述引用不超過25~30條。但是，也有人主張只要符合上述要求而必要的文獻仍然可以引用，不應拘泥於嚴格的限制。