舉世矚目的奧運會承載著億萬中國人的百年夢想，在國際奧委會對第29屆奧運會所面臨的風險進行的分析中，傳染病的暴發或流行是主要的風險之一。王全意同志XX年起開始參加第29屆奧運會和第13屆殘奧會傳染病風險識別與分析工作，對22種可能對北京市公共衛生安全造成威脅的傳染病進行分析研究，按照國際先進的矩陣理論模型，對各種傳染病的威脅進行半定量分析，為奧運會公共衛生保障的籌備工作奠定了基礎。XX年起，他開展了奧運會傳染病症狀監測系統的研究，在國內率先建立了中小學生早期預警監測系統、傳染病相關藥品銷售監測系統、職工因病缺勤系統、社區衛生服務中心就醫行為監測等早期預警監測系統，提高了北京市傳染病監測的水平。在奧運召開期間，他具體負責傳染病的監測、流行病學調查和疫情處理工作，對奧運會的圓滿成功發揮了不可或缺的作用。特別是在奧運召開期間，建立了對涉奧人員和城市聚集性病例進行5種症狀的監測和流行病學調查系統，通過在93家奧運場館內的157所醫療點和全市125家二級以上的醫院對涉奧人員、外籍病例和關聯性病例進行監測、報告、流行病學調查和傳染病排查，發現了多起傳染病和食物中毒線索，通過及時採取措施將這些隱患及時控制，避免對奧運會造成不良影響，確保了奧運會的順利召開。此項工作得到了衛生部、北京市政府的高度讚揚，衛生部陳竺部長專門批示肯定了該項工作。
王全意不僅在非典防控、抗震救災和奧運保障工作中做出了重要貢獻。作為一名公共衛生醫師，他在公共衛生研究中也取得了重要的成績。他1996年起在國內較早開展了愛滋病的社會行為學研究，為我國早期愛滋病政策的制定提供了理論依據。XX年完成全國公眾結核病防治知識態度行為調查，建立了我國公眾結核病知曉率指標體系，為我國結核病健康促進工作提供了重要的基礎數據。他先後完成國家863、衛生部、世界衛生組織、世界銀行、全球基金、北京市自然科學基金資助項目十餘項，發表論文80多篇，獲省部級科技成果獎1項。
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