直接責任人承擔60%，科室負責人承擔15%，分管領導承擔15%，院長承擔10%。
限期未繳納違約金的，加收10%的滯納金，並按照以下規定依次執行：
1.扣除單位經費；
2.在新農合回補資金中扣除；
3.情節嚴重的，依法停業整頓。
收取的違約金專款專用，按規定上繳財政，並由政府全額返還，作為對縣鄉醫療機構規範管理的獎金。獎金不足部分由縣衛生局統籌解決
（二）制定醫院規範管理年考核標準，明確獎勵辦法
為明確醫療機構規範管理的具體工作任務，按照醫療機構規範管理的相關規定，結合縣鄉醫療機構工作實際及工作重點，制定了“醫院規範管理年考核標準”（以下簡稱“考核標準”），由醫院規範管理年領導組組織進行量化考核評分。考核評分按照以下規定執行：
1.作為縣鄉公立醫療機構績效工資管理依據。考評分70分為合格，每少1分扣單位總績效工資的5%（其中：對院長、副院長黃牌警告或免職留用，全額扣除績效工資），以此類推，扣完為止。
2.對私立醫院考核評分規定：考評分70分為合格，每少1分扣3000元，以此類推，65分以下停止新農合報賬，60分以下停業整頓。
3.作為縣鄉公立醫療機構及民營綜合醫院評比獎勵的依據。評比規則如下：
（1）一等獎一名，獎金2萬元，考核分至少90分有評比資格。
（2）二等獎二名，獎金1萬元，考核分至少85分有評比資格。
（3）三等獎三名，獎金0.6萬元，考核分至少80分有評比資格。
獎項按照評分依次評比，獎金可分到人，院長占40%，其餘由院長決定分配。
對各級醫療機構的檢查與考核時間不再發文通知，請各醫療機構分別在6月、12月中旬以前對照“考核標準”上報自查評分。
七、附則
本方案自印發之日起施行，可根據實際適時修訂完善。