二、存在的困難和問題
1、人員編制不足
（1）鄉鎮衛生院。鎮衛生院現有在編人員15人，其中醫師8名，護士2名，調劑師2名，檢驗師1名，放射科1名，其他人員1名。在職工作人員中，有4人被借調。服務人口2.3萬人。
根據《內蒙古自治區人民政府關於基層醫藥衛生體制綜合改革試點的實施意見》（內政發【XX】25號）檔案精神，蘇木鄉鎮衛生院編制按農牧業戶籍人口的1.3‰實行總量控制，並分類核定。巴音陶亥鎮衛生院應安排編制27名（按2.1萬人口計算），其中中醫師1名，專職公共衛生人員4名，護士5名，全科醫師5名，各類醫技人員11名，其他人員1名。現缺編制人數12名。拉僧廟衛生院和老石旦衛生院機構存在，但不經營。
（2）社區衛生服務中心。按照《關於印發內蒙古自治區城市社區衛生服務機構設定和編制標準實施意見的通知》（內機編辦發【XX】32號）檔案精神，服務居民1-5萬名的社區衛生服務中心，按每萬名居民配備2-3名全科醫師、1名公共衛生醫師，全科醫師與護士的比例1:1配備，具體計算時，服務居民超過1萬的，萬後尾數≥5000，按1萬計算。拉僧仲社區衛生服務中心服務居民39000人，應安排編制26名，其中全科醫師8名，公共衛生醫師4名，護士12名，其他人員2名。現臨時聘用工作人員21名，尚缺5名。公烏素社區衛生服務中心服務居民24200人，應安排編制17名，其中全科醫師5名，公共衛生醫師3名，護士8名，其他人員1名。現有在編人員7名，其他人員均為臨聘人員。
由於基層社區缺乏必要的專業技術人員，影響其正常業務的開展。
2、鄉村一體化改革推進緩慢
根據內蒙古自治區衛生廳《關於清理整頓內蒙古自治區嘎查村衛生室的通知》（內衛農字【180】號）檔案要求，每個行政村設定村衛生室1個。整合後村衛生室數量暫不能解決現有農區居民對基本公共衛生服務的需求。海南區現有農區人口2.3萬人，自然村衛生室26個。每個村民小組之間距離遠、跨度大、從南到北跨度70多公里。按照科學規劃、合理布局的設定原則，村衛生室的設定必須有利於合理配置農村衛生資源，有利於滿足廣大民眾的預防保健和基本醫療需求。村醫多渠道合理補償機制尚未健全，村醫工作積極性不高，隊伍不穩定。依據《內蒙古自治區深化醫藥衛生體制改革近期重點實施方案（XX-XX）》檔案精神，對鄉村醫生承擔的公共衛生服務給予合理補助，補助金額每人每年不低於XX元。目前對村醫補償機制不完善，平均每個村醫每月僅補100元。由於行政村衛生室尚未確定，村衛生室仍未實行藥品零差率銷售，鎮衛生院難以對村衛生室實行“五統一”管理，阻礙了鄉村衛生服務一體化進程。
3、基層醫療衛生機構運行經費不足。
基層社區運行經費嚴重不足，各基層社區除開展一般診療服務外，還承擔轄區內基本公共衛生服務，由於各基層社區沒有核定人員編制，大部分為臨聘人員，工資由業務收入及基本公共衛生服務經費中支出，導致各基層社區運行經費嚴重不足。此外，拉僧仲社區衛生服務中心及公烏素社區衛生服務中心近期搬入新樓，由於缺乏經費購置必要的設備，導致業務無法正常開展。
4、缺乏必備的應急裝備。
由於我區是自然災害頻發地區，做好突發公共事件處理，最大限度的預防和減少突發公共事件及其造成的損失，需配齊配強各種應急裝備，需要提供資金保障。