企業將款項存入銀行等金融機構時，借記“銀行存款”科目，貸記“現金”等有關科目；提取或支付在銀行等金融機構中的存款時，借記“現金”等有關科目，貸記“銀行存款”科目。
企業在銀行的其他存款，如外埠存款、銀行本票存款銀行匯票存款、在途貨幣資金、信用證存款等，在“其他貨幣資金”科目核算，不通過“銀行存款”科目進行會計處理。
為了加強對銀行存款的管理，及時掌握銀行存款收付的動態和結存的餘額，企業必須設定“銀行存款日記賬”，按照銀行存款收付業務發生的先後順序逐筆序時登記，每日終了應結出餘額。“銀行存款日記賬”應定期與“銀行對賬單”核對，至少每月核對一次。企業賬面結餘與銀行對賬單餘額之間如有差額，必須逐筆查明原因，並按月編制“銀行存款餘額調節表”調節相符。月份終了，“銀行存款日記賬”的餘額必須與“銀行存款”總賬科目的餘額核對相符。
有外幣業務的企業，應在“銀行存款”科目下分別人民幣和各種外幣設定“銀行存款日記賬”進行明細核算。