1.合併會計報表審計目標：
（1）合併會計報表的合併範圍是否正確、完整；
（2）合併會計報表的合併基礎是否正確、完整；
（3）合併會計報表的合併結果是否正確；
（4）合併會計報表及附註各項目的披露是否恰當。
2．合併會計報表的審計程式
（1）審查合併會計報表的合併範圍及其變動是否符合有關規定。
（2）審查合併會計報表的合併基礎是否正確。包括：
①審查合併會計報表工作底稿所列個別會計報表是否經審計。如經審計，則與審定後個別會計報表核對相符，並考慮個別會計報表審計意見對合併會計報表的影響程度；如由其他註冊會計師審計，則應對其出具的審計報告、提供的資料進行複審、分析和判斷，必要時，可以以審計問卷的方式請求答覆，如規模較小，其資產總額、主營收入、淨利潤等在企業集團中所占比例不大，則可要求該子公司提供與合併報表及其附註有關的明細資料。
②審查子公司會計報表決算日和會計期間是否一致。若不一致，應提請被審計單位按規定披露該子公司的名稱和不一致的原因，或以母公司為基準對子公司會計報表的決算日和會計期間進行必要的調整。
③審查母、子公司採用的會計政策是否一致。若存在重大不一致，且對合併的財務狀況、經營成果和現金流量產生重大影響，註冊會計師應提請被審計單位在編制合併會計報表時對子公司的會計報表作必要的調整；當然，若相差不大且影響也不大，根據重要性原則可不作調整，但註冊會計師應提請被審計單位在合併會計報表附註中進行必要的說明，以免會計報表使用者產生誤解。
④審查母公司對子公司長期投資的核算方法是否符合有關規定，對納入合併範圍的所有子公司是否均已採用權益法核算。
（3）審查合併會計報表的合併結果是否正確。
①審查母公司對子公司的權益性資本與子公司所有者權益的抵銷分錄是否正確，合併價差是否正確、產生原因是否合理。
②審查集團內公司間的內部交易，及由此形成的期末存貨、固定資產中包含的未實現內部銷售利潤抵銷事項的處理是否正確。
③審查集團內公司間的債權債務（包括壞賬準備在內）的抵銷事項是否正確。
④審查集團內公司間的內部投資收益，子公司期初未分配利潤與子公司本期利潤分配和期末未分配利潤的抵銷事項的處理是否正確。
⑤關注以前年度集團內公司間交易對本期合併會計報表編制的影響，審查有關的抵銷分錄是否正確。