性狀
元素組成：c、h、n（絕大多數含氧，個別含其他元素，如cl、s）。
┌ 結晶（多數）
│
形狀 ┤ 無定型粉末（少數）
│
└ 液體（小分子且無氧原子，或氧原子以酯鍵存在）
┌ 有一定的熔點或沸點
│
熔點 ┤ 有的有雙熔點
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└ 有的為分解點
┌ 多數有苦味，少數有其他味覺，如甜味。
│
其他 ┤ 揮發性或升華性（液體生物鹼或小分子生物鹼）
│
└ 白色或無色透明體（少數結構中有較長共軛體系的生物鹼有顏色。）
鏇光性
生物鹼結構中有手性碳原子或手性分子，則具有鏇光性。
┌ 手性碳原子的構型
│
影響生物鹼鏇光性的因素 ┤ ┌ 熔劑
│ │
│ │ ph
└ 測定時的 ┤
│ 濃度
│
└ 溫度
生物鹼的生理活性與其鏇光性有關，一般左鏇體的生理活性比右鏇體強。
溶解度★★★
┌ 氮原子的存在狀態
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│ 分子的大小
│
·影響生物鹼溶解度的因素 ┤ 功能團的種類
│
│ 功能團的數目
│
└ 溶劑的種類