建成後的北京檢驗檢疫局數據中心繫統具有數據採集、數據套用和管理維護三大類功能：數據採集功能負責從業務數據源中抽取、清理和轉換數據，實現數據從各業務數據源向數據中心的移動；數據套用功能用於以多種形式展示統計數據，具體包括數據查詢、統計月報、預警分析和業務報表；管理維護功能是保證系統正常運行的基石，由數據中心繫統中管理維護模組的管理子系統和維護子系統實現。其中，管理子系統主要進行系統信息的管理，如用戶管理、許可權管理，同時還可以進行系統審計；維護子系統主要面向數據和套用系統進行維護，保證套用系統的正常運行，並保持套用系統的豐富多樣。
通過以上三大功能，數據中心繫統成功地解決了北京檢驗檢疫局信息化發展中遇到的問題，但建設數據中心不僅是一項長期的、艱巨的、複雜的系統工程，需要投入巨大的人力、物力、財力，更是一項漸進完善的工程，需要不斷充實數據源，系統才能不斷更新。當然，這也是一項充滿光明前途的工程，它不僅能為領導科學決策提供有力支持，還對提高檢驗檢疫系統科學管理、高效執法發揮巨大的推動作用。